Ingénieur Bioinformatique – Cancer & Immunité (Single‑cell)

CNRS; Bordeaux; Sur place; EUR 35 000 - 38 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Prise en charge mobilité durable 300€

Congés RTT 44 jours

Indemnisation TT

Résumé du poste

Le CNRS, unité IBGC à Bordeaux, recrute un ingénieur en bioinformatique pour analyser et intégrer des ensembles de données moléculaires à haut débit. Le poste implique collaboration avec des biologistes et cliniciens et l’utilisation d’infrastructures du Centre de bioinformatique de Bordeaux.

Le candidat doit avoir un doctorat en bioinformatique ou discipline apparentée et une expérience en analyses omiques, avec une maîtrise de R et Python et des compétences en analyses spatiales et

Qualifications

• Le candidat doit être titulaire d’un doctorat en bioinformatique ou biologie computationnelle et justifier d’une expérience en analyse de données moléculaires.
• Maîtrise de R et/ou Python pour l’analyse de données biologiques, la modélisation statistique et la visualisation.
• Bonne connaissance des méthodes de transcriptomique unicellulaire et des analyses omiques.

Responsabilités

• Analyser des données transcriptomiques unicellulaires et réaliser QC, normalisation, intégration des ensembles, clustering et annotation cellulaire.
• Intégrer des données épigénomiques unicellulaires (scChIP-seq) et les corréler avec l’expression génique.
• Analyser des données transcriptomiques spatiales et les intégrer à des références unicellulaires.
• Étudier la communication intercellulaire via des approches ligand–récepteur et synthétiser les résultats.
• Développer et maintenir des workflows reproductibles et documenter les méthodes et résultats.

Connaissances

R

Python

Transcriptomique unicellulaire

Anglais CECRL C1

Formation

Doctorat en bioinformatique ou biologie computationnelle

Outils

Xenium

scChIP-seq

RNA-seq

Description du poste

Le CNRS, unité IBGC à Bordeaux, recrute un ingénieur en bioinformatique pour analyser et intégrer des ensembles de données moléculaires à haut débit. Le poste implique collaboration avec des biologistes et cliniciens et l’utilisation d’infrastructures du Centre de bioinformatique de Bordeaux.

Le candidat doit avoir un doctorat en bioinformatique ou discipline apparentée et une expérience en analyses omiques, avec une maîtrise de R et Python et des compétences en analyses spatiales et