Stagiaire Bioinformatique & Analyse Single-Cell en Oncologie

Servier; Villiers-le-Bâcle; On-site; EUR 11,000 - 16,000; Full time

Benefits offered by this job

Télétravail partiel jusqu’à 8 jours/mo

Horaires flexibles

Accès à la Salle de sport

Navette Servier

Avantages Groupe (intéressement et/ou)

Job summary

Servier Paris-Saclay R&D Institute recrute un(e) stagiaire Biologiste Computationnel pour exploiter un atlas single-cell des tumeurs cérébrales et identifier biomarqueurs. Vous travaillerez dans l’équipe In Silico Target Insight, en collaboration avec bio-informaticiens et biologistes.

Vous appliquerez un pipeline d’analyse, évaluerez des cibles et réseaux de signalisation, et présenterez vos résultats lors de réunions techniques.

Qualifications

• Étudiant(e) en Master 2 ou dernière année d'école d'ingénieur, avec une spécialisation en bioinformatique, biostatistiques ou biologie computationnelle.
• Maîtrise des outils standards d’analyse single cell sur Python (scanpy, anndata, numpy) et R (Seurat, inferCNA, scDblFinder).
• Utilisation d’outils de reproductibilité (Nextflow, pip/uv/pixi). Environnement (bash, HPC, Git).

Responsibilities

• Analyser des données single-cell et mettre en œuvre un pipeline robuste incluant QC, normalisation, clustering et annotation cellulaire.
• Évaluer la pertinence des cibles thérapeutiques et des voies de signalisation au sein de sous-populations cellulaires.
• Inférer des réseaux de signalisation et caractériser les profils cellulaires par co-activation.
• Présenter les résultats de manière pédagogique lors de réunions techniques avec les bio-informaticiens et les biologistes.

Skills

bioinformatique

biostatistiques

biologie computationnelle

Python

Education

Master 2 / école d'ingénieur

Tools

scanpy

anndata

Seurat

inferCNA

scDblFinder

Job description

Servier Paris-Saclay R&D Institute recrute un(e) stagiaire Biologiste Computationnel pour exploiter un atlas single-cell des tumeurs cérébrales et identifier biomarqueurs. Vous travaillerez dans l’équipe In Silico Target Insight, en collaboration avec bio-informaticiens et biologistes.

Vous appliquerez un pipeline d’analyse, évaluerez des cibles et réseaux de signalisation, et présenterez vos résultats lors de réunions techniques.