Ingénieure Bioinformatique Protéomique — Pipelines & Données

Région Nouvelle-Aquitaine; Bordeaux; Sur place; EUR 60 000 - 75 000; Plein temps

Résumé du poste

Région Nouvelle-Aquitaine recherche un Référent bioinformatique pour la plateforme proteomique. Vous piloterez l’analyse de grands jeux de données, assurerez le contrôle qualité bioinformatique et produirez des résultats fiables pour nos projets R&D et nos clients des secteurs cosmétique et agricole.

Vous développerez et maintiendrez le pipeline interne (Python, R), effectuerez les imports et conversions depuis Spectronaut et DIA-NN, et contribuerez

Qualifications

• Connaissance en analyse des données protéomiques et bioinformatique.
• Maîtrise des concepts de contrôle qualité des données.
• Capacité à travailler sur de grands jeux de données et à produire des livrables scientifiques.

Responsabilités

• Traiter et analyser les données protéomiques quantitatives.
• Développer et maintenir le pipeline interne (Python, R).
• Réaliser les imports et conversions depuis Spectronaut, DIA-NN ou Proteome Discoverer.
• Filtrer et imputer les valeurs manquantes et contrôler la qualité.
• Réaliser les analyses statistiques et l’enrichissement fonctionnel.
• Générer des matrices et des réseaux d’interaction protéique (Cytoscape).
• Rédiger des SOPs et documentations Qualité.

Connaissances

Bioinformatique

Analyse des données

Qualité des données

Outils

Python

R

Proteome Discoverer

Spectronaut

Description du poste

Région Nouvelle-Aquitaine recherche un Référent bioinformatique pour la plateforme proteomique. Vous piloterez l’analyse de grands jeux de données, assurerez le contrôle qualité bioinformatique et produirez des résultats fiables pour nos projets R&D et nos clients des secteurs cosmétique et agricole.

Vous développerez et maintiendrez le pipeline interne (Python, R), effectuerez les imports et conversions depuis Spectronaut et DIA-NN, et contribuerez