Ingénieur Bioinformatique — Génomique & Évolution Nématodes

CNRS; Villeurbanne; Hybrid; EUR 35,000 - 54,000; Full time

Benefits offered by this job

44 jours RTT

Indemnisation TT 75% up to 300€

Job summary

CNRS, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule à Villeurbanne, recherche un ingénieur de recherche en bio-informatique pour étudier le processus PDE chez Mesorhabditis et d’autres éléments génomiques. Le poste implique l’assemblage de génomes, l’annotation et l’analyse de variants, dans un cadre 24 mois.

Date de démarrage souhaitée: janvier 2027. Le candidat idéal possède un master en bio-informatique (doctorat recommandé) et maîtrise des pipelines (Nextflow/Snakemake), R et

Qualifications

• Master en bio-informatique requis.
• Un doctorat en bio-informatique est fortement recommandé.
• Expérience en pipelines et analyses génomiques souhaitée.

Responsibilities

• Assembler les génomes de 10 souches de Mesorhabditis et espèces proches (long reads + Hi-C).
• Annoter le génome de référence et traiter manuellement les familles de transposons.
• Réaliser l’appel de variants (SNPs, INDELs, SV) et étudier la mobilité des transposons.

Skills

Pipelines bioinformatiques

Analyse de données

Langages de programmation

Education

Master en bio-informatique

Doctorat en bio-informatique (recommandé)

Tools

Nextflow

Snakemake

R

Python

C++

Job description

CNRS, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule à Villeurbanne, recherche un ingénieur de recherche en bio-informatique pour étudier le processus PDE chez Mesorhabditis et d’autres éléments génomiques. Le poste implique l’assemblage de génomes, l’annotation et l’analyse de variants, dans un cadre 24 mois.

Date de démarrage souhaitée: janvier 2027. Le candidat idéal possède un master en bio-informatique (doctorat recommandé) et maîtrise des pipelines (Nextflow/Snakemake), R et