Ingénieur Bioinformatique: RNA-seq & Indexation Omics

Service Formation Continue Université de Montpellier

Montpellier

On-site

EUR 24,000 - 31,000

Full time

4 days ago

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Benefits offered by this job

Congés annuels jusqu’à 46 jours

Télétravail jusqu’à 2 jours/semaine

Restauration collective

Aide et prestations sociales

Prise en charge partielle des abonnés

Job summary

Service Formation Continue de l'Université de Montpellier recherche un(e) ingénieur(e) en bioinformatique pour le projet ESCALATE, afin de tester et valider Reindeer 2 et d’analyser des données RNA-seq liées au cancer. Vous travaillerez en équipe, concevrez des pipelines et participerez à des publications scientifiques.

Le poste implique une mission de 16 mois ou plus, avec un démarrage en décembre 2026, sur Montpellier.

Qualifications

Expérience confirmée en bioinformatique et analyses Omics.
Maîtrise des pipelines bioinformatiques et de l’indexation de données à grande échelle.
Bon esprit d’équipe et autonomie dans un contexte collaboratif.

Responsibilities

Benchmarking des nouvelles structures d’indexation (quantification, détection d’événements rares).
Automatisation des designs de sondes de kmers en collaboration avec Paris Saclay.
Réalisation d’analyses différentielles et identification de biomarqueurs via des données OMICS.
Déploiement des structures d’indexation pour des données multiOmique et partage via GitHub.
Rédaction de rapports, participation à des publications et communications.