Ingénieur / Ingénieure de recherche scientifique (H/F)

CNRS; Paris; On-site; EUR 45,000 - 60,000; Full time

Job summary

CNRS recrute un-e ingénieur-e bioinformaticien(ne) pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. Vous analyserez des données single-nucleus RNA-seq générées dans un modèle de transplantation in vivo d'unités tumorales humaines au sein d'un embryon aviaire.

Vous développerez des pipelines bioinformatiques reproductibles, effectuerez des annotations cellulaires et analyses de trajectoires développementales, et présenterez les résultats sous forme de

Job description

Mission

Nous recrutons un-e ingénieure / ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nucleus RNA-seq générées à partir d'un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d'émergence au sein d'un embryon aviaire.

Activités

Les missions principales incluront :

• Analyse et traitement des données single-nucleus.
• Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients humaines publiques ou des nouvelles données issues de collaborations.
• Application de méthodes bio-informatiques pour l'annotation cellulaire, l'identification de sous-populations, l'analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d'enrichissement en processus biologiques etc.
• Collaboration étroite avec les biologistes de l'équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses.
• Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité.
• Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques.