Ingénieur Bioinformatique — Cancer pédiatrique, RNA-seq

CNRS; Lyon; Vor Ort; EUR 26.000 - 31.000; Vollzeit

Benefits dieser Stelle

Indemnisation TT 75%

Forfait mobilité durable jusqu’à 300€

44 jours RTT annuels

Zusammenfassung

CNRS Lyon-Est recrute un·e ingénieur bioinformaticien(ne) pour analyser des données single-nucleus RNA-seq issues d’un modèle de transplantation in vivo chez l’embryon aviaire, dans le cadre d’un projet en cancérologie pédiatrique.

Vous travaillerez au sein d’une équipe pour développer des pipelines et interpréter les résultats, avec présentation des conclusions dans des rapports et figures scientifiques. Contrat CDD de 6 mois renouvelable, rémunération à partir de 2521€ brut selon expérience.

Qualifikationen

• Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique ou biostatistiques est recommandé.
• Expérience confirmée en analyse de données single-cell/single-nucleus indispensable.
• Maîtrise de R et Python et gestion de données.

Aufgaben

• Analyser des données single-nucleus RNA-seq générées dans un modèle aviaire.
• Comparer résultats avec données publiques ou collaborations.
• Annoter cellulaires et identifier sous-populations.
• Analyser trajectoires developmentales et communications cellulaires.
• Développer des pipelines reproductibles et fiables.
• Présenter résultats sous forme de rapports et figures scientifiques.

Kenntnisse

Single-cell data analysis

R programming

Python programming

Seurat

CellChat

GSEA

Autonomie

Capacité à travailler en équipe

Ausbildung

Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique/biostatistiques

Tools

Seurat

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Jobbeschreibung

CNRS Lyon-Est recrute un·e ingénieur bioinformaticien(ne) pour analyser des données single-nucleus RNA-seq issues d’un modèle de transplantation in vivo chez l’embryon aviaire, dans le cadre d’un projet en cancérologie pédiatrique.

Vous travaillerez au sein d’une équipe pour développer des pipelines et interpréter les résultats, avec présentation des conclusions dans des rapports et figures scientifiques. Contrat CDD de 6 mois renouvelable, rémunération à partir de 2521€ brut selon expérience.