Ingénieur Bioinformatique & Design Protéique – Pipeline HPC

Cnrs; Lyon; Sur place; EUR 42 000 - 60 000; Plein temps

Résumé du poste

CNRS, au sein du Groupe Etude et conception de composés biologiquement actifs du Laboratoire de Biologie tissulaire et ingénierie thérapeutique, recrute un ingénieur en bioinformatique et design protéique computationnel pour développer un pipeline robuste et reproductible.

Le candidat intégrera des outils de computational protein design et automatisera des workflows, en interaction avec la bioinformatique, la biologie structurale, la biophysique et la biologie expérimentale, sous supervision

Qualifications

• Diplôme: Licence dans les domaines listés, Master apprécié.
• Excellente maîtrise du Python.
• Expérience en programmation scientifique ou développement de workflows.
• Bonne maîtrise de l'environnement Linux.
• Capacité à utiliser et intégrer des logiciels scientifiques.
• Connaissance de Git et des principes de développement logiciel.
• Capacité à analyser et manipuler des données biologiques ou structurales.
• Autonomie dans la recherche de solutions techniques.
• Bonnes capacités d'analyse et de résolution de problèmes.

Responsabilités

• Développer un workflow automatisé: génération de structures, design de séquences, prédiction structurale, analyse, filtrage et ranking.
• Mener l'implémentation du pipeline et développer des scripts et modules en Python.
• Automatiser des workflows scientifiques et intégrer des logiciels existants.
• Gérer les entrées/sorties, les configurations et les campagnes de calcul.
• Exécuter et suivre des calculs sur GPU/HPC; assurer les logs et les reprises de calcul.

Connaissances

Python

Workflow development

Linux

Git

Software integration

Data analysis

Autonomy

Problem solving

Scientific programming

Formation

Licence en bioinformatique / sciences du vivant

Master en biosciences / informatique

Outils

Git

GPU HPC

Description du poste

CNRS, au sein du Groupe Etude et conception de composés biologiquement actifs du Laboratoire de Biologie tissulaire et ingénierie thérapeutique, recrute un ingénieur en bioinformatique et design protéique computationnel pour développer un pipeline robuste et reproductible.

Le candidat intégrera des outils de computational protein design et automatisera des workflows, en interaction avec la bioinformatique, la biologie structurale, la biophysique et la biologie expérimentale, sous supervision