Bioinformaticien (H/F)

Abolis Biotechnologies; Arrondissement d'Évry; On-site; EUR 70,000 - 100,000; Full time

Benefits offered by this job

Titres restaurants

Télétravail

Remboursement Navigo

Mutuelle

Environnement convivial

Parking

CE

Job summary

Une entreprise de biotechnologie recherche un ingénieur en bioinformatique structurale pour développer des pipelines d'analyse et réaliser des visualisations de données. Le candidat idéal est titulaire d'un Bac+5/+8 avec au moins 5 ans d'expérience. Ce poste offre un CDI, des projets stimulants et un environnement convivial.

Qualifications

• Diplôme Bac+5/+8 et 5 ans d'expérience en bioinformatique structurale.
• Connaissances en analyse des génomes et séquençage.
• Compétences en chimie et mécanismes catalytiques.

Responsibilities

• Développer et faire tourner des pipelines d'analyse.
• Réaliser des analyses statistiques et visualisations sur les données.
• Rédiger rapports scientifiques et suivis d'activité.
• Concevoir des plans d’expérience et coordonner les travaux avec les équipes Wet Lab
• Rédiger rapports et suivis d’activité pour clients/partenaires
• Réaliser une veille scientifique et bibliographique sur les sujets concernés

Skills

Analyse des génomes

Programmation

Biophysique

Machine learning

Communication en anglais

Education

Bac+5/+8 en biologie moléculaire ou discipline connexe

Tools

Boltz

Snakemake

Git

Python

NumPy

Job description

Le poste

Abolis Recherche Un Ingénieur En Bioinformatique Structurale (H/F) Pour Rejoindre Notre Département Biologie. Vous Aurez La Responsabilité De

• Développer et faire tourner des pipelines permettant d'analyser les génomes, reconstruire les structure 3D des enzymes, docker et analyser les ligands à haut débit
• Développer et faire tourner des pipelines d'analyse de génome et de RNAseq
• Construire des bases de données d’enzyme naturelle
• Réaliser des analyses statistiques et des visualisations sur les données (scikitlearn, numpy, matplotlib, plotly...)
• Analyse des données produites par les pipelines pour proposer aux équipes de biologie de nouvelles enzymes ainsi que des mutants ou des bibliothèque de mutant pour optimiser stabilité et activité.
• Concevoir des plans d'expérience réalisées par les équipes du Wet Lab selon les objectifs et moyens disponibles.
• Analyser les résultats expérimentaux (moléculaire, génétique, OMICS, fermentation) et identifier les bottlenecks enzymatiques.
• Travailler selon la stratégie scientifique et communiquer les résultats en interne et externe
• Rédiger rapports scientifiques, livrables, présentations et suivis d'activité pour clients/partenaires
• Réaliser la veille scientifique et bibliographique sur les sujets concernés

Profil Recherché

Vous êtes diplômé(e) d’une formation Bac+5/+8 en biologie moléculaire, modélisation des protéines et des interactions protéine-ligand ou discipline connexe et vous justifiez d’une de 5 ans minimum et d’une expérience réussie en bioinformatique structurale.

1. Vous codez avec aisance et vous connaissez les derniers outils (Boltz, Snakemake...) et bonnes pratiques de programmation (Git, maintenabilité, reproductibilité, etc).
2. Vous connaissez un minimum l'analyse des génomes et données de séquençage.
3. Vous connaissez la biophysique (champ de force, MD...) et le machine learning (deeplearning, stable diffusion,...) qui sous-tendent les logiciels que utilisez. Vous comprenez comment vous paramétrez l'algorithme ou le modèle.
4. Vous comprenez bien la chimie et les mécanismes réactionnels des sites catalytique des enzymes, ainsi que les interactions qui permettent d'en augmenter l'activité ou le binding.
5. Vous êtes rigoureux(se), curieux(se), très organisé(e), vous avez un esprit de synthèse porté sur les résultats, vous êtes force de proposition, vous savez vous adapter et avez la capacité de travailler en équipe.
6. Une très bonne maîtrise de l’anglais est fortement recommandée.

Les avantages

• CDI à pourvoir dès que possible
• Rémunération : (selon profil)
• Titres restaurants, RIE, télétravail, Mutuelle, Remboursement Navigo, Parking, CE...
• Des projets challengeants et intéressants, couvrant quasiment toutes les classes d'enzymes
• Un environnement convivial avec des équipes dynamiques et engagées