Bioinformaticien(ne) en Transcriptomique Spatiale — Immunologie

Inserm France; Marseille; Hybride; EUR 52 000 - 70 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Mutuelle

Remboursement frais de transport

Restauration collective

Résumé du poste

Inserm recherche un ingénieur·e biologiste en traitement de données pour analyser la transcriptomique spatiale. Vous travaillerez sur des données Xenium et collaborerez avec les équipes du site de Marseille, en France.

Le candidat idéal maîtrise R et Python, et possède une expérience en analyses single-cell et en pipelines bioinformatiques. Poste en CDI à temps plein, avec implication dans des publications et l’équipe pluridisciplinaire.

Qualifications

• Maîtrise des outils R et Python et des suites Bioconductor pour l’analyse omique.
• Expérience avec les données transcriptomiques spatiales et analyses single-cell.
• Connaissance des environnements Unix/Linux et du contrôle de versions Git.

Responsabilités

• Concevoir et optimiser des panels Xenium personnalisés pour l atlas cellulaire.
• Traiter et analyser des données Xenium et réaliser des contrôles qualité.
• Identifier types/cell states et analyser les interactions tissulaires.
• Rédiger rapports et contribuer à publications scientifiques.

Connaissances

R

Python

Seurat/Scanpy

Bioconductor

Unix/Linux

Git

Formation

Master's degree

Outils

Xenium

PASTIS pipeline

Seurat

Scanpy

Description du poste

Inserm recherche un ingénieur·e biologiste en traitement de données pour analyser la transcriptomique spatiale. Vous travaillerez sur des données Xenium et collaborerez avec les équipes du site de Marseille, en France.

Le candidat idéal maîtrise R et Python, et possède une expérience en analyses single-cell et en pipelines bioinformatiques. Poste en CDI à temps plein, avec implication dans des publications et l’équipe pluridisciplinaire.