Ingénieur Bioinformatique – Cancer et Immunité Cellulaire

Cnrs; Bordeaux; Sur place; EUR 52 000 - 75 000; Plein temps

Résumé du poste

CNRS Bordeaux, IBGC, recrute un ingénieur bioinformatique pour un projet interdisciplinaire réunissant biologie du cancer, immunologie, épigénétique et bioinformatique.

Vous analyserez et intégrerez des données unicellulaires et spatiales (scRNA-seq, scChIP-seq, Visium/Xenium) afin d’étudier l’hétérogénéité cellulaire et les niches tumorales, avec collaboration avec biologistes et cliniciens. Le poste demande le développement de workflows reproductibles et une forte traçabilité des analyses.

Qualifications

• Docteur en bioinformatique ou discipline apparentée avec expérience en analyses moléculaires à haut débit.
• Maîtrise avancée de R et/ou Python pour l’analyse biologique et la visualisation.
• Expérience en transcriptomique unicellulaire: QC, normalisation, intégration et annotation.
• Connaissances des méthodes statistiques pour données haute dimension et conception expérimentale.
• Capacité à développer des workflows reproductibles et bien documentés.

Responsabilités

• Analyser des données transcriptomiques unicellulaires (QC, normalisation, intégration, clustering et annotation).
• Traiter et analyser des données épigénomiques unicellulaires (scChIP-seq) et les relier à l’expression génique.
• Analyser des données transcriptomiques spatiales (Visium/Xenium/ATERA) et les intégrer à des références unicellulaires.

Connaissances

R

Python

Biologie computationnelle

Modélisation statistique

Intégration de données

Visualisation

Formation

Doctorat en bioinformatique ou biologie computationnelle

Outils

scRNA-seq analysis

ChIP-seq

Spatial transcriptomics

Description du poste

CNRS Bordeaux, IBGC, recrute un ingénieur bioinformatique pour un projet interdisciplinaire réunissant biologie du cancer, immunologie, épigénétique et bioinformatique.

Vous analyserez et intégrerez des données unicellulaires et spatiales (scRNA-seq, scChIP-seq, Visium/Xenium) afin d’étudier l’hétérogénéité cellulaire et les niches tumorales, avec collaboration avec biologistes et cliniciens. Le poste demande le développement de workflows reproductibles et une forte traçabilité des analyses.