Stage en bioinformatique: métagénomique & méthanisation

SFBI; Antony; Sur place; EUR 6 700 - 8 900; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Stage rémunéré selon tarifs légaux

Environnement pluridisciplinaire INRAE

Résumé du poste

INRAE PROSE recherche un stagiaire en bioinformatique pour préparer et explorer des données métagénomiques liées à la méthanisation, en lien avec des modélisateurs et expérimentateurs. Vous contribuerez à l’assemblage, l’annotation de gènes et l’analyse des MAGs, et développerez des profils de k-mers.

Le stage de 6 mois débutera en janvier 2027 au sein de l’unité INRAE PROSE à Antony (92). Rigueur, autonomie et travail collaboratif seront essentiels; rémunération selon les tarifs légaux en

Qualifications

• Maîtrise d’un langage adapté (R ou Python) et aisance avec les données de séquençage haut-débit et les approches statistiques.
• Rigueur, autonomie, capacités d’analyse et de synthèse, bon esprit collaboratif.

Responsabilités

• Préparer et explorer les données bioinformatiques du projet.
• Adapter et exécuter les chaînes de traitement existantes (assemblage, gènes, MAGs).
• Développer des analyses ciblées et comparer le contenu informatif par analyses multivariées.
• Visualiser les patterns des échantillons et quantifier les liens entre structure des communautés et les paramètres du procédé.

Connaissances

R

Python

Analyse de données

Description du poste

INRAE PROSE recherche un stagiaire en bioinformatique pour préparer et explorer des données métagénomiques liées à la méthanisation, en lien avec des modélisateurs et expérimentateurs. Vous contribuerez à l’assemblage, l’annotation de gènes et l’analyse des MAGs, et développerez des profils de k-mers.

Le stage de 6 mois débutera en janvier 2027 au sein de l’unité INRAE PROSE à Antony (92). Rigueur, autonomie et travail collaboratif seront essentiels; rémunération selon les tarifs légaux en