Stage: Cartographie des régions de réarrangements pour variantes

SFBI; Évry-Courcouronnes; On-site; EUR 13,000 - 16,000; Part time

Job summary

Le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), situé au Genopole d’Evry, recrute un stagiaire Master 2 pour inventorier les zones de recombinaison et prioriser les variants dans un projet de re-sequencage de génomes complets. Vous travaillerez dans le laboratoire de Bio-analyse avec des données de séquençage à longues lectures et des bases de données publiques.

Ce stage de 6 mois offre une immersion en génomique médicale et nécessite des compétences en Bash, Python, R et SQL sous

Qualifications

• Stage de 6 mois en Master 2 (Bac+5).
• Compétences en programmation et bio-informatique.
• Bonne connaissance des environnements Linux.

Responsibilities

• Inventorier les zones de recombinaison décrites dans la littérature et les bases de données pour une recherche ciblée.
• Annoter et prioriser les variants identifiés lors du re-séquencage longues lectures.
• Réaliser une recherche bibliographique et développer une stratégie expérimentale.
• Collaborer au développement des outils et de la stratégie du laboratoire Bio-analyse.

Skills

bash

Python

R

SQL

Education

Master / M2

Tools

Linux

GitLab

Nextflow

Conda

Job description

Le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), situé au Genopole d’Evry, recrute un stagiaire Master 2 pour inventorier les zones de recombinaison et prioriser les variants dans un projet de re-sequencage de génomes complets. Vous travaillerez dans le laboratoire de Bio-analyse avec des données de séquençage à longues lectures et des bases de données publiques.

Ce stage de 6 mois offre une immersion en génomique médicale et nécessite des compétences en Bash, Python, R et SQL sous