Stage Master 2 - Data Science & Bioinformatics QC/WGS

bioMérieux; Marcy-l'Étoile; On-site; EUR 8,900 - 12,000; Full time

Benefits offered by this job

Indemnité stage conforme à la loi

Remboursement des frais de transport

Accès à des ressources de pointe

Job summary

bioMérieux recrute un stagiaire au sein du département Data Science pour améliorer un pipeline d’analyse de données de séquençage métagénomique et participer au QC des données utilisées par les modèles de ML.

Vous travaillerez en France et aux États‑Unis sur des données WGS, en collaboration avec les équipes internationales, afin d’optimiser les stratégies de contrôle qualité et la restitution des résultats, et développerez du code reproductible.

Qualifications

• Stage en Bac+5 / Master 2 en bioinformatique ou domaine connexe.
• Expérience en analyse de données de séquençage génomique (WGS) et intérêt pour la microbiologie.
• Maîtrise de Python et Bash; gestion de versions (GitHub).
• Connaissance des approches de ML et reproductibilité des analyses.
• Bonnes capacités d'analyse et communication écrite/orale en anglais.

Responsibilities

• Organiser et structurer de grands jeux de données WGS et suivre les indicateurs de qualité.
• Développer du code reproductible pour l'analyse des données génomiques.
• Collaborer avec les équipes Data Science France-US sur les développements techniques.
• Synthétiser les résultats et les communiquer à des publics non techniques.
• Participer à la définition et à l’évaluation des critères QC pour les modèles ML.

Skills

Python

Bash

Git

Anglais

Analyse de données

Education

Master 2 en Bioinformatique

Tools

GitHub

Job description

bioMérieux recrute un stagiaire au sein du département Data Science pour améliorer un pipeline d’analyse de données de séquençage métagénomique et participer au QC des données utilisées par les modèles de ML.

Vous travaillerez en France et aux États‑Unis sur des données WGS, en collaboration avec les équipes internationales, afin d’optimiser les stratégies de contrôle qualité et la restitution des résultats, et développerez du code reproductible.