Ingénieur H/F en Bioinformatique

CNRS; Lyon; Vor Ort; EUR 26.000 - 31.000; Vollzeit

Benefits dieser Stelle

Indemnisation TT 75%

Forfait mobilité durable jusqu’à 300€

44 jours RTT annuels

Zusammenfassung

CNRS Lyon-Est recrute un·e ingénieur bioinformaticien(ne) pour analyser des données single-nucleus RNA-seq issues d’un modèle de transplantation in vivo chez l’embryon aviaire, dans le cadre d’un projet en cancérologie pédiatrique.

Vous travaillerez au sein d’une équipe pour développer des pipelines et interpréter les résultats, avec présentation des conclusions dans des rapports et figures scientifiques. Contrat CDD de 6 mois renouvelable, rémunération à partir de 2521€ brut selon expérience.

Qualifikationen

• Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique ou biostatistiques est recommandé.
• Expérience confirmée en analyse de données single-cell/single-nucleus indispensable.
• Maîtrise de R et Python et gestion de données.

Aufgaben

• Analyser des données single-nucleus RNA-seq générées dans un modèle aviaire.
• Comparer résultats avec données publiques ou collaborations.
• Annoter cellulaires et identifier sous-populations.
• Analyser trajectoires developmentales et communications cellulaires.
• Développer des pipelines reproductibles et fiables.
• Présenter résultats sous forme de rapports et figures scientifiques.

Kenntnisse

Single-cell data analysis

R programming

Python programming

Seurat

CellChat

GSEA

Autonomie

Capacité à travailler en équipe

Ausbildung

Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique/biostatistiques

Tools

Seurat

CellChat

GSEA

Jobbeschreibung

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Mécanismes en sciences intégratives du vivant

Durée du contrat

6 mois

Rémuneration

A partir de 2521€ brut selon expérience

Description du Poste

Les Missions

Nous recrutons un·e ingénieure / ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nucleus RNA-seq générées à partir d’un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d’émergence au sein d’un embryon aviaire.

L'Activité

Les missions principales incluront :

• Analyse et traitement des données single-nucleus.
• Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients humaines publiques ou des nouvelles données issues de collaborations.
• Application de méthodes bio-informatiques pour l’annotation cellulaire, l’identification de sous-populations, l’analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d’enrichissement en processus biologiques etc.
• Collaboration étroite avec les biologistes de l’équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses.
• Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité.
• Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques.

Votre Profil

Compétences

• Formation : Un Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, biostatistiques sera un atout. Une expérience confirmée en analyse de données single-cell ou single-nucleus est indispensable.
• Compétences techniques : Expérience en programmation (R, Python) et en gestion de données. Maîtrise des outils d'analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA etc.).
• Qualités personnelles : Rigueur, autonomie et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire.

Votre Environnement de Travail

• Contrat CDD de 6 mois renouvelable 6 mois

L'Ingénieur H/F sera intégré à une équipe comprenant 1 ingénieur Bio-informaticien, et sera environné d'autres expertises en analyse de données. L'unité est située au coeur du campus de Lyon-Est à proximité des transports en commun.

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 2521€ brut selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

Référence de l’offre

Secteur d’activité

Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement

Emploi type

Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.