Ingénieur Bioinformatique & Informatique – Métabolisme Big Data

SFBI; Toulouse; Sur place; EUR 25 000 - 31 000; Plein temps

Résumé du poste

INRAE - Toxalim à Toulouse recherche un ingénieur en informatique ou bioinformatique pour concevoir et déployer des outils d’analyse et de modélisation sur des réseaux métaboliques.

Vous travaillerez dans un cadre Big Data et collaborerez avec des biologistes et bio-informaticiens pour développer des solutions interopérables et robustes, avec un accent sur la reproductibilité et les API externes.

Qualifications

• Master 2 en informatique, informatique ou bioinformatique.
• Connaissances en web sémantique (RDF, SPARQL).
• Maîtrise d’Apache Spark, idéal GraphFrames.
• Langages Scala (préféré) ou Java.
• Bon niveau d’anglais.

Responsabilités

• Concevoir et déployer des outils d’analyse et de modélisation pour interroger une base de connaissances regroupant plusieurs milliers de réseaux métaboliques.
• Développer des graphes de connaissances et des solutions d’interrogation.
• Mettre en place une API accessible depuis l’extérieur.
• Collaborer avec les biologistes et bio-informaticien.nes de l’unité et de l’infrastructure.

Connaissances

Web sémantique

Apache Spark

Scala

Java

Anglais

Bioinformatique

Graph theory

Formation

Master 2 en informatique ou bioinformatique

Outils

GraphFrames

RDF

SPARQL

Description du poste

INRAE - Toxalim à Toulouse recherche un ingénieur en informatique ou bioinformatique pour concevoir et déployer des outils d’analyse et de modélisation sur des réseaux métaboliques.

Vous travaillerez dans un cadre Big Data et collaborerez avec des biologistes et bio-informaticiens pour développer des solutions interopérables et robustes, avec un accent sur la reproductibilité et les API externes.