Ingénieur Informatique Bioinfo: Graphes et API Métaboliques

INRAE; Toulouse; Sur place; EUR 42 000 - 62 000; Plein temps

Résumé du poste

INRAE recrute dans l’unité Metatooul/MetaboHUB pour développer des outils d’analyse et de modélisation de réseaux métaboliques. Vous travaillerez sur une architecture Big Data (datalake) et contribuerez à l’interrogation de bases de connaissances contenant des milliers de réseaux métaboliques.

Le poste implique de concevoir des graphes de connaissances, de mettre en place une API et de collaborer étroitement avec des biologistes et bioinformaticien·nes pour répondre à des questions scientifiques

Qualifications

• Master 2 en informatique spécialisé en systèmes d’information, data science et/ou calcul intensif ou bioinformatique.
• Connaissances en RDF, SPARQL et architecture Big Data.
• Maîtrise d’Apache Spark et GraphFrames est un plus.
• Bon niveau d’anglais et travail en équipe multidisciplinaire.

Responsabilités

• Concevoir et déployer des outils d’analyse et de modélisation sur des réseaux métaboliques.
• Mettre en place une API pour accéder aux outils depuis l’extérieur.
• Collaborer avec biologistes et bioinformaticien·nes pour adapter les outils aux questions scientifiques.
• Assurer rigueur, reproductibilité et documentation des workflows.

Connaissances

RDF

SPARQL

GraphFrames

Scala

Java

Web sémantique

Big Data

Bioinformatique

Formation

Master 2 informatique, data science ou bioinformatique

Outils

Apache Spark

Description du poste

INRAE recrute dans l’unité Metatooul/MetaboHUB pour développer des outils d’analyse et de modélisation de réseaux métaboliques. Vous travaillerez sur une architecture Big Data (datalake) et contribuerez à l’interrogation de bases de connaissances contenant des milliers de réseaux métaboliques.

Le poste implique de concevoir des graphes de connaissances, de mettre en place une API et de collaborer étroitement avec des biologistes et bioinformaticien·nes pour répondre à des questions scientifiques