Ingénieur Bioinformatique et Dév. Logiciel – ADNe

Centre Lasers Intenses et Applications; Toulouse; Sur place; EUR 32 000 - 38 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Prise en charge transport 75%

RTT 44 jours

Forfait mobilité durable 300€

Résumé du poste

Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’Environnement (CRBE) à Toulouse recrute un ingénieur de recherche en bioinformatique et développement logiciel. Vous contribuerez au PEPR Dynabiod et développerez un package R pour évaluer des amorces et marqueurs moléculaires utilisés pour le métabarcoding ADN.

Vous gérerez les séquences de référence, automatiserez les requêtes et pourriez concevoir une application web associée.

Qualifications

• Master ou diplôme d’ingénieur avec expérience ≥ 2 ans en développement logiciel bioinformatique.
• Connaissance théorique des techniques d’ADN environnemental et métabarcoding.
• Anglais technique (lecture et rédaction de publications).

Responsabilités

• Concevoir et développer en langage R (fonctions, tests unitaires, documentation).
• Automatiser l’interrogation de ressources en ligne (GenBank, BOLD, SILVA) pour créer et mettre à jour les bases de référence.
• Si le temps le permet, développer une application web associée au package.

Connaissances

R programming

Unix

Git

Bioinformatics

Anglais technique

Formation

Master ou diplôme d’ingénieur

Outils

R

devtools/roxygen2/testthat/usethis

GitLab/GitHub

Bases de données

Description du poste

Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’Environnement (CRBE) à Toulouse recrute un ingénieur de recherche en bioinformatique et développement logiciel. Vous contribuerez au PEPR Dynabiod et développerez un package R pour évaluer des amorces et marqueurs moléculaires utilisés pour le métabarcoding ADN.

Vous gérerez les séquences de référence, automatiserez les requêtes et pourriez concevoir une application web associée.