Ingénieur Bioinformatique – API & Métabolomique

INRAE; Saint-Genès-Champanelle; Sur place; EUR 21 000 - 26 000; Plein temps

Résumé du poste

INRAE vous invite à rejoindre l’Unité de Nutrition Humaine, au sein de la Plateforme d’Exploration du Métabolisme (PFEM), pour concevoir et développer un outil intégrant des données métabolomiques et phénotypiques. Vous travaillerez sous responsabilité du responsable bioinformatique dans l’infrastructure MetaboHUB.

La mission combine développement logiciel, bioinformatique et pratiques DevOps, avec déplacements prévus à Rennes et Toulouse.

Qualifications

• Formation en informatique, bioinformatique ou domaine équivalent.
• Première expérience en développement Python et conception d’API.
• Connaissance de la métabolomique, des graphes de connaissances ou du Web sémantique appréciée.

Responsabilités

• Développer des microservices et des API REST en Python.
• Intégrer ces services aux ressources et graphes FORVM.
• Mettre en place des tests automatisés et des pipelines d’intégration et de déploiement continus.

Connaissances

Python développement

API REST

Automatisation

Formation

Informatique / bioinformatique

Outils

Docker

Galaxy

Git

Description du poste

INRAE vous invite à rejoindre l’Unité de Nutrition Humaine, au sein de la Plateforme d’Exploration du Métabolisme (PFEM), pour concevoir et développer un outil intégrant des données métabolomiques et phénotypiques. Vous travaillerez sous responsabilité du responsable bioinformatique dans l’infrastructure MetaboHUB.

La mission combine développement logiciel, bioinformatique et pratiques DevOps, avec déplacements prévus à Rennes et Toulouse.