Bioinformaticien(ne) - Analyses Génomiques & Télomères

INSERM; Nice; On-site; EUR 45,000 - 65,000; Full time

Job summary

Inserm, IRCAN, Nice, recherche un bioinformaticien pour analyser des données omiques liées au cancer et au vieillissement. Vous travaillerez sur des données de séquençage Oxford Nanopore et des analyses transcriptomiques, au sein d’une équipe pluridisciplinaire.

Le poste implique l’utilisation d’outils comme STAR, Bowtie2, DESeq2 et l’analyse de grandes masses de données, avec une attention portée à la reproductibilité et à la diffusion des résultats.

Qualifications

• Bonnes connaissances en génomique des eucaryotes
• Maîtrise de Linux/Unix
• Notions en programmation (Python fortement souhaité, R ou C++)
• Maîtriser l'anglais technique du domaine

Responsibilities

• Analyser des données de séquençage long-read Oxford Nanopore et caractériser les variations structurales
• Réaliser des analyses transcriptomiques (lncRNA-seq) et quantifier les ARN non codants
• Exploiter et présenter les résultats des analyses
• Rédiger des rapports d’expériences ou d’études et participer à publications

Skills

Génomique des eucaryotes

Linux/Unix

Programmation Python

R

Anglais technique

Tools

MACS

bwa

STAR

bowtie2

BedTools

SamTools

DESeq2

SSH

Job description

Inserm, IRCAN, Nice, recherche un bioinformaticien pour analyser des données omiques liées au cancer et au vieillissement. Vous travaillerez sur des données de séquençage Oxford Nanopore et des analyses transcriptomiques, au sein d’une équipe pluridisciplinaire.

Le poste implique l’utilisation d’outils comme STAR, Bowtie2, DESeq2 et l’analyse de grandes masses de données, avec une attention portée à la reproductibilité et à la diffusion des résultats.