Postdoc: Antigen-Specific Single-Cell Profiling

Rijksoverheid; Bilthoven; Hybrid; EUR 39,000 - 62,000; Part time

Benefits offered by this job

IKB (Individueel Keuzebudget)

OV-reiskostenvergoeding en secundaire火

Job summary

RIVM, onderdeel van de Rijksoverheid, is op zoek naar een onderzoeker die zich richt op immunologie en single-cell analyses. Je werkt met klinische cohorts en geavanceerde sequencing-technieken, en levert resulaten die beleidsbeslissingen ondersteunen.

De positie vereist een PhD in immunologie, ervaring met flow cytometrie en cel-sortering, en sterke data-analysevaardigheden in R of Python. Hybride werken en tweejarige aanstelling zijn mogelijk.

Qualifications

• PhD in immunology is required.
• Solid foundation in T- or B-cell biology.
• Experience with cellular immunology techniques such as flow cytometry and cell sorting; single-cell experience a plus.
• Strong affinity for analyzing large datasets in R or Python, ideally single-cell omics.
• Structured and resilient approach to complex workflows and troubleshooting.
• Clear English communication in spoken and written form.

Responsibilities

• Ontwerpen en uitvoeren van laboratoriumexperimente voor flow cytometrie en single-cell omics.
• Analyseren en visualiseren van flow cytometry en single-cell datasets.
• Coördineren en waarborgen van tijdige en kwalitatieve projectleveringen.
• Publiceren onderzoeksresultaten in peer-reviewed journals.
• Presenteren onderzoeksresultaten op meetings en conferenties.

Skills

Flow cytometry

Cell sorting

Single-cell analysis

Immunology

Data analysis

Education

PhD in immunology

Tools

R

Python

Job description

Dit ga je doen

Can we distinct short- and long-term cellular immunity in order to improve vaccination strategies? In this position at RIVM you will contribute to public health by generating and analyzing single-cell datasets for exploring why longevity of cellular immunity induced by different vaccines and pathogens differs. You will have access to unique clinical cohorts, cutting-edge flow cytometry and sequencing technologies, and dedicated bioinformatic support. This two-year post offers a collaborative, research-focused environment where your daily laboratory work shapes meaningful scientific insights.

Your responsibilities

Understanding the mechanisms behind why cell-mediated immunity lasts for decades after certain infections or vaccines, while fading quickly after others, is crucial for designing next-generation public health strategies. In this two-year position you address this question by mapping antigen-specific B and T cell responses at single-cell resolution.

Your primary focus is the hands‑on generation and analysis of single-cell datasets from clinical cohorts. Working within a dedicated project team, you profile cellular immune responses triggered by various pathogens and vaccines to evaluate both the depth and longevity of protection. You work closely alongside an experienced bioinformatician to integrate, interpret, and translate complex laboratory data into immunological insights.

Your key tasks include:

• Designing and performing laboratory experiments for generating flow cytometry and single-cell omics datasets from human clinical studies on cellular responses following infection or vaccination.
• Analyzing and visualizing flow cytometry and single-cell datasets.
• Coordinating and safeguarding the timing and quality of completing project deliverables.
• Publishing research results in peer-reviewed journals to communicate findings.
• Presenting research outcomes at meetings and conferences.

By generating these high-dimensional single-cell datasets, you help uncover the biological determinants of durable immunity, offering evidence that can refine future vaccination frameworks. Beyond the daily laboratory and data work, you will have access to advanced sequencing technologies and patient samples, with space to strengthen your analytical approach and share findings through peer-reviewed scientific publications.

About the department

The Centre for Immunology of Infectious Diseases and Vaccines (IIV) at the Dutch National Institute for Public Health and the Environment (RIVM) conducts high-impact research on how the immune system responds to vaccines and infections. We focus on protecting vulnerable groups such as infants and older adults. Our Immune Mechanisms – Correlates of Protection (IMC) department identifies biomarkers of protective immunity through clinical studies, contributing to vaccine effectiveness and policy decisions. For this project you will work closely with a principal investigator, a bioinformatician, and a technician. You will regularly collaborate with the project team to share progress and exchange ideas in an open, supportive environment. As a team, we tackle challenges together and celebrate our milestones with a slice of cake. You will also participate in IMC department and IIV centre meetings, giving you the opportunity to discuss research with fellow scientists. Beyond that, you can connect with colleagues informally during centre lunches, drinks, and social activities. We offer a flexible working environment through our hybrid work policy. We gather on-site two fixed days a week to connect as a team and with the broader centre, while offering the flexibility to work remotely when your tasks allow.

Dit krijg je

• Schaal 10 €3.496 - €5.535 (bruto)
• Arbeidsovereenkomst voor bepaalde tijd
• 2 jaar
• 32 - 36 uur
• Het salaris is gebaseerd op een werkweek van 36 uur.

Dit bieden we nog meer

Naast het salaris ontvang je een Individueel Keuzebudget (IKB). Het IKB bestaat uit geld (16,50% van je bruto jaarsalaris) en tijd. Met het IKB maak jij de keuzes die bij jou passen en kun je een deel van je maandinkomen te laten uitbetalen wanneer jij dat wenst. Ook kun je dit budget omzetten in verlof en andersom of besteden aan fiscaal vriendelijke doelen. De Rijksoverheid hecht sterk aan persoonlijke groei en loopbaanontwikkeling en biedt daarvoor tal van mogelijkheden. Tot de secundaire arbeidsvoorwaarden behoren onder meer verschillende studiefaciliteiten, bedrijfsfitness, volledige vergoeding van je OV-reiskosten woon-werkverkeer en gedeeltelijk betaald ouderschapsverlof.

Dit vragen wij

Job requirements

To be successful in this position, the following knowledge and experience is required:

• You hold a PhD in immunology, preferably focused on infectious diseases.
• You possess a solid foundation in T or B cell biology.
• You bring practical experience with cellular immunology techniques such as flow cytometry and cell sorting. Prior experience with single-cell techniques is a plus.
• You have a strong affinity for analyzing large datasets in R or python, ideally single-cell omics, enabling you to translate high-dimensional biological data into actionable scientific insights.
• You work with a structured and resilient approach, which helps you navigate complex experimental workflows, troubleshoot methodologically, and adapt to changing research demands.
• You communicate clearly in spoken and written English, allowing you to collaborate effectively within multidisciplinary teams and share your findings with the broader scientific community.

Bij het RIVM hebben we één van de beste cao's van Nederland, namelijk die van de Rijksoverheid. Naast een goed salaris hebben we aantrekkelijke arbeidsvoorwaarden zoals een Individueel Keuzebudget van 16.5 % van je bruto jaarsalaris waarover je zelf de regie hebt. Je kunt iedere maand een deel laten uitbetalen of extra vrije dagen kopen of verkopen. Daarnaast bieden we fiscale voordelen om bijvoorbeeld je studieschuld af te lossen. Ook zijn we een mantelzorgvriendelijke organisatie. Meer weten? Lees er meer over onder de kop ‘overige arbeidsvoorwaarden’.

Over RIVM

RIVM: deskundig, betrouwbaar en onafhankelijk

Als Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM) zijn we een deskundige, betrouwbare en onafhankelijke adviseur voor overheid, professionals en burgers. Ons doel: een gezonde bevolking en een duurzame, veilige en gezonde leefomgeving. We bewaken gezondheid, ziekten, de kwaliteit van de leefomgeving én het milieu. Daarvoor doen we onderzoek en we verzamelen kennis voor toegankelijke informatie en toepasbare adviezen. Het RIVM zorgt voor een goede geboortescreening, het bestrijden van infectieziekten en heeft een centrale rol bij het Rijksvaccinatieprogramma en de bevolkingsonderzoeken. We onderzoeken wat er nodig is voor goede zorg, een gezonde leefstijl, veilige producten en een veilige en gezonde leefomgeving. Ook dragen we bij aan het voorkomen, bestrijden en beheersen van incidenten en crises.

Terwijl we druk de verhuizing voorbereiden naar een prachtig nieuw gebouw op het Utrecht Science Park, werken we op ons huidige hoofdkantoor in Bilthoven met ongeveer 3000 collega’s aan al onze adviezen, rapporten, factsheets en publicaties. Daarbij laten we ons leiden door de vragen van vandaag én morgen. We doen ons werk midden in de maatschappij. Trots zijn we op onze organisatie waar iedereen welkom is. Als kennisinstituut van de overheid willen we een afspiegeling van de samenleving zijn. Naast talent, ervaring en motivatie maken ook aspecten van identiteit zoals leeftijd, geaardheid, culturele achtergrond of arbeidsbeperking, onze organisatie rijker, innovatiever én leuker. Met deze verschillende achtergronden, perspectieven en inzichten werken wij samen aan een nog beter resultaat! RIVM – De zorg voor morgen begint vandaag