Stage en Génomique des Populations des PAPAM à La Réunion

SFBI; Saint-Pierre; On-site; EUR 5,500 - 6,900; Full time

Job summary

Stage de Master 2 (6 mois) à l’Université de La Réunion - UMR PVBMT, Saint-Pierre (La Réunion). Le/la stagiaire développera une chaîne d’analyse bioinformatiques pour caractériser la diversité génétique des PAPAM et interpréter les résultats face aux gradients climatiques de l’île.

Il/elle contribuera à des analyses GWAS potentielles et à la rédaction de rapports scientifiques, avec présentation des résultats et participation aux réunions d’équipe.

Qualifications

• Connaissances approfondies en génétique et génomique des populations.
• Aisance dans la manipulation et le traitement des données (scripts bash, langage R…).
• Autonomie et esprit d’initiative.
• Aisance dans l’écriture de rapports scientifiques et la communication orale.
• Une première expérience dans l’analyse de données NGS sera très appréciée.

Responsibilities

• Mettre en place et appliquer une chaîne d’analyse bioinformatique (QC, mapping, SNP calling)
• Développer et adapter des scripts d’analyses en génétique des populations
• Animer des réunions d’équipe dédiées à l’analyse et discussion des résultats
• Participer aux sorties de terrain pour l’identification taxonomique des accessions
• Participer aux événements de communication du projet TrétZerbaj et du consortium

Skills

Génétique des populations

Génomique

Scripts Bash

R (statistiques)

Education

Master 2 (Bac+5)

Tools

R (statistiques)

Job description

Stage de Master 2 (6 mois) à l’Université de La Réunion - UMR PVBMT, Saint-Pierre (La Réunion). Le/la stagiaire développera une chaîne d’analyse bioinformatiques pour caractériser la diversité génétique des PAPAM et interpréter les résultats face aux gradients climatiques de l’île.

Il/elle contribuera à des analyses GWAS potentielles et à la rédaction de rapports scientifiques, avec présentation des résultats et participation aux réunions d’équipe.