Transcriptomique PFAS: Réponse de Lepidodinium et bactériome

SFBI; Nantes; On-site; EUR 7,800 - 10,000; Full time

Job summary

Ifremer, Unité PHYTOX, Nantes, recherche un stagiaire de Master 2 pour analyser les données transcriptomiques et interpréter les réponses de Lepidodinium chlorophorum face à des PFAS. Le stage implique une analyse bioinformatique et statistique, avec une orientation vers l’interprétation biologique et l’écologie microbienne.

Le poste est à Nantes, en collaboration avec le laboratoire GENALG, et offre l’opportunité de travailler dans un holobionte algal-microbien, en environnement Linux et avec R

Qualifications

• Master 2 spécialisé en bioinformatique, génomique, ou équivalent.
• Expérience ou formation en analyse de données RNA‑seq/transcriptomiques souhaitée.
• Bonnes bases en statistiques et maîtrise de Linux et R.

Responsibilities

• Analyser et interpréter les données RNA‑seq obtenues.
• Identifier les mécanismes moléculaires liés à la réponse à PFAS chez Lepidodinium chlorophorum et son bacteriome.
• Évaluer les voies métaboliques et l’expression des gènes chez l’algue et les bactéries associées.

Skills

RNA‑seq analyse

Linux

R

Statistiques

Génomique fonctionnelle

Interprétation des données

Education

Master 2 / Bac+5 en bioinformatique

Tools

RNA‑seq pipelines

Job description

Ifremer, Unité PHYTOX, Nantes, recherche un stagiaire de Master 2 pour analyser les données transcriptomiques et interpréter les réponses de Lepidodinium chlorophorum face à des PFAS. Le stage implique une analyse bioinformatique et statistique, avec une orientation vers l’interprétation biologique et l’écologie microbienne.

Le poste est à Nantes, en collaboration avec le laboratoire GENALG, et offre l’opportunité de travailler dans un holobionte algal-microbien, en environnement Linux et avec R