Stage BAC+5: Épidémiologie Génomique & Data Science

bioMérieux SA

Lyon

On-site

EUR 12,000 - 19,000

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Restaurant d’entreprise
Remboursement des transports
Conciergerie sur les sites

Job summary

bioMérieux recherche un stagiaire BAC+5 en épidémiologie génomique pour rejoindre le département Data Science sur le site de Marcy-l'Étoile. Vous analyserez des méthodes d’épidémiologie génomique et contribuerez à l’évaluation et à l’amélioration des approches utilisées pour suivre la transmission de bactéries pathogènes.

Vous travaillerez en interface entre bioinformatique, microbiologie et science des données, avec un tuteur et des experts du domaine, et vous serez amené(e) à documenter et

Qualifications

  • Étudiant(e) en dernière année d'école d'ingénieur ou Master 2 en bioinformatique, data science avec une sensibilisation génomique ou discipline équivalente
  • Intérêt marqué pour la génomique microbienne et l’analyse de données biologiques
  • Connaissances en séquençage haut débit (2ème et 3ème génération) et en bioinformatique
  • Expérience en Python et environnement Linux
  • Capacité d’analyse, esprit critique et curiosité scientifique
  • Bon niveau d’anglais scientifique

Responsibilities

  • Étudier et comparer les méthodes d’épidémiologie génomique utilisées pour détecter et suivre la transmission de bactéries
  • Concevoir et appliquer des workflows bioinformatiques pour évaluer différentes approches
  • Analyser les performances des méthodes et leur robustesse sur des jeux de données réels
  • Évaluer l’impact de la qualité des données sur les résultats et les performances
  • Contribuer à l’élaboration de règles d’interprétation et de recommandations techniques

Skills

Python
Linux
Anglais scientifique
Analyse de données
Bioinformatique

Education

Master 2 en bioinformatique
École d'ingénieur ou équivalent

Tools

Python
Linux
Linux CLI

Job description

bioMérieux recherche un stagiaire BAC+5 en épidémiologie génomique pour rejoindre le département Data Science sur le site de Marcy-l'Étoile. Vous analyserez des méthodes d’épidémiologie génomique et contribuerez à l’évaluation et à l’amélioration des approches utilisées pour suivre la transmission de bactéries pathogènes.

Vous travaillerez en interface entre bioinformatique, microbiologie et science des données, avec un tuteur et des experts du domaine, et vous serez amené(e) à documenter et

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