Stage Bioinformatique ML en Microbiologie – VITEK MS Prime

bioMérieux SA; Marcy-l'Étoile; Sur place; EUR 13 000 - 20 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Restaurant d’entreprise

Remboursement transports

Conciergerie sur les sites

Résumé du poste

bioMérieux recherche un stagiaire BAC+5 en bioinformatique avec une spécialisation en machine learning appliqué à la microbiologie. Le stage se déroule sur le site de Marcy-l'Étoile au sein du Département de Recherche en Microbiologie et du Laboratoire de Spectrométrie de Masse.

Vous évoluerez dans un contexte pluridisciplinaire et bénéficierez d'un tutorat expérimenté, d’un accompagnement et d’une évaluation régulière pour préparer votre vie professionnelle et suivre vos progrès.

Qualifications

• Stage BAC+5 en bioinformatique avec orientation Machine Learning en microbiologie.
• Formation à l'utilisation des ressources de calcul et développement d'outils internes.
• Participation au développement de méthodes d'analyse de données de spectrométrie de masse.
• Conception et déploiement d'outils sur la plateforme interne bioMérieux.

Responsabilités

• S'immerger dans la problématique du laboratoire et se former au travail pratique.
• Développer et tester des solutions techniques en collaboration avec l'équipe.
• Proposer une solution technique et échanger avec le laboratoire.
• Implémenter la solution retenue et déployer l'outil sur la plateforme interne.

Connaissances

R

Python

Linux CLI

Git & GitLab

Snakemake

Nextflow

Shiny

Streamlit

Bioinformatics

Mass spectrometry

Proteomics

Taxonomy & phylogeny

Formation

Master 2 informatique/science des données/bioinformatique

Stage de 6 mois en bioinformatique

Outils

GitLab

Snakemake

Nextflow

Shiny

Streamlit

Description du poste

bioMérieux recherche un stagiaire BAC+5 en bioinformatique avec une spécialisation en machine learning appliqué à la microbiologie. Le stage se déroule sur le site de Marcy-l'Étoile au sein du Département de Recherche en Microbiologie et du Laboratoire de Spectrométrie de Masse.

Vous évoluerez dans un contexte pluridisciplinaire et bénéficierez d'un tutorat expérimenté, d’un accompagnement et d’une évaluation régulière pour préparer votre vie professionnelle et suivre vos progrès.