Senior Bioinformatician, Genomics & Diagnostic Analytics

HOSPICES CIVILS DE LYON; Bron; Sur place; EUR 42 000 - 65 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Télétravail partiel possible

Résumé du poste

Les Hospices Civils de Lyon recrutent un bioinformaticien(ne) pour structurer l’activité d’accompagnement des projets de recherche et les analyses de données de séquençage.

Titulaire d’un Master 2 en bioinformatique (ou domaine connexe) avec au moins 2 ans d’expérience, vous interviendrez sur des projets de génomique et d’informatique médicale, avec des perspectives d’évolution vers le CDI et des possibilités de travail sur site et télétravail selon les besoins.

Qualifications

• Expérience d’analyse de données de séquençage ou génotypage.
• Connaissance des approches multi-omics et des pipelines bioinformatiques.
• Bonnes pratiques de développement et documentation des analyses.
• Aptitude à travailler en équipe et autonomie.
• Capacité à former et accompagner les utilisateurs.

Responsabilités

• Accompagnement des équipes dans la conception de leurs projets et la recherche de financement
• Réalisation d’analyses bioinformatiques et développement de solutions innovantes
• Supervision des bioinformaticiens juniors
• Valorisation des développements par publications ou transfert en diagnostic
• Réalisation de tests de nouvelles technologies
• Participation aux activités courantes de la cellule et formation des utilisateurs

Connaissances

Outils bioinformatiques

Scripting Bash/Perl/Python

R et analyses statistiques

Intégration multi-omique

Bonnes pratiques Dev/CI

Linux/Unix

Git

Docker/Singularity

Snakemake/Nextflow

SLURM

Machine Learning

Formation

Master 2 en bioinformatique ou domaine connexe

Outils

Docker

Singularity

Nextflow

Snakemake

Git

SLURM

Description du poste

Les Hospices Civils de Lyon recrutent un bioinformaticien(ne) pour structurer l’activité d’accompagnement des projets de recherche et les analyses de données de séquençage.

Titulaire d’un Master 2 en bioinformatique (ou domaine connexe) avec au moins 2 ans d’expérience, vous interviendrez sur des projets de génomique et d’informatique médicale, avec des perspectives d’évolution vers le CDI et des possibilités de travail sur site et télétravail selon les besoins.