Ingénieur Recherche – Caractérisation d’E. coli STEC

Université de Caen Normandie; Normandie; Sur place; EUR 40 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

L’Université de Caen Normandie recherche un ingénieur.e de recherche pour caractériser des souches d’Escherichia coli STEC dans le cadre du projet EFFAS. Vous réaliserez des expérimentations et analyerez des données génomiques et transcriptomiques en laboratoire.

Vous travaillerez au sein des unités Dynamicure et ABTE, en collaboration avec un enseignant-chercheur, et contribuerez au fonctionnement des laboratoires.

Qualifications

• Réaliser des expérimentations de microbiologie et biologie moléculaire.
• Analyser des données génomiques et transcriptomiques.
• Rédiger des rapports d’essai et des publications.

Responsabilités

• Se former et s’habiliter à la manipulation de microorganismes de niveau de sécurité 3.
• Se former et s’habiliter à la manipulation en laboratoire de niveau de sécurité P3.
• Contribuer à l’analyse génomique d’une collection de 50 souches STEC.
• Extraire des ARN de cultures bactériennes en conditions de stress définies, préparer et expédier les échantillons pour le séquençage des ARN.
• Collecter, traiter et analyser les données de transcriptomique après séquençage avec l’aide d’un enseignant-chercheur.
• Contribuer au fonctionnement collectif des laboratoires d’accueil (Dynamicure et ABTE équipe MALIM)

Connaissances

Expérimentation microbiologie

Biologie moléculaire

Génomique

Transcriptomique

Anglais scientifique

Formation

BAC +5 en Microbiologie

Outils

Outils de bioinformatique

Description du poste

L’Université de Caen Normandie recherche un ingénieur.e de recherche pour caractériser des souches d’Escherichia coli STEC dans le cadre du projet EFFAS. Vous réaliserez des expérimentations et analyerez des données génomiques et transcriptomiques en laboratoire.

Vous travaillerez au sein des unités Dynamicure et ABTE, en collaboration avec un enseignant-chercheur, et contribuerez au fonctionnement des laboratoires.