Ingénieur.e de recherche pour la caractérisation de souches d'Escherichia coli – ABTE / DYNAMICURE

Université de Caen Normandie; Normandie; Sur place; EUR 40 000 - 55 000; Plein temps

Résumé du poste

L’Université de Caen Normandie recherche un ingénieur.e de recherche pour caractériser des souches d’Escherichia coli STEC dans le cadre du projet EFFAS. Vous réaliserez des expérimentations et analyerez des données génomiques et transcriptomiques en laboratoire.

Vous travaillerez au sein des unités Dynamicure et ABTE, en collaboration avec un enseignant-chercheur, et contribuerez au fonctionnement des laboratoires.

Qualifications

• Réaliser des expérimentations de microbiologie et biologie moléculaire.
• Analyser des données génomiques et transcriptomiques.
• Rédiger des rapports d’essai et des publications.

Responsabilités

• Se former et s’habiliter à la manipulation de microorganismes de niveau de sécurité 3.
• Se former et s’habiliter à la manipulation en laboratoire de niveau de sécurité P3.
• Contribuer à l’analyse génomique d’une collection de 50 souches STEC.
• Extraire des ARN de cultures bactériennes en conditions de stress définies, préparer et expédier les échantillons pour le séquençage des ARN.
• Collecter, traiter et analyser les données de transcriptomique après séquençage avec l’aide d’un enseignant-chercheur.
• Contribuer au fonctionnement collectif des laboratoires d’accueil (Dynamicure et ABTE équipe MALIM)

Connaissances

Expérimentation microbiologie

Biologie moléculaire

Génomique

Transcriptomique

Anglais scientifique

Formation

BAC +5 en Microbiologie

Outils

Outils de bioinformatique

Description du poste

Ingénieur.e de recherche pour la caractérisation de souches d'Escherichia coli – ABTE / DYNAMICURE

Réf. Référence : 2026-2419608

• Fonction publique : Fonction publique de l'État
• Employeur : Université de Caen Basse-Normandie Université de Caen Normandie
• Localisation : Caen

Domaine : Recherche

Date limite de candidature : 24/10/2026

• Fonction publique : Fonction publique de l'État
• Employeur : Université de Caen Basse-Normandie Université de Caen Normandie
• Localisation : Caen
• Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
• Nature du contrat Non renseigné
• Expérience souhaitée Non renseigné
• Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
• Catégorie Catégorie A (cadre)
• Management Non renseigné
• Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Positionnement Hiérarchique

DESMASURES Nathalie / ISNARD Christophe

Missions Principales Du Poste

Expérimentation et analyses de données génomiques et transcriptomiques de souches de Escherichia coli STEC dans le cadre du projet EFFAS. « EFFAS – Caractérisation génomique et phénotypique de souches d’Escherichia coli STEC et évaluation de leur sensibilité aux stress pour le développement de ferments bioprotecteurs en filière fromagère AOP au lait cru ».

Activités Et Tâches Du Poste

• Se former et s’habiliter à la manipulation de microorganismes de niveau de sécurité 3,
• Se former et s’habiliter à la manipulation en laboratoire de niveau de sécurité P3,
• Contribuer à l’analyse génomique d’une collection de 50 souches STEC,
• Extraire des ARN de cultures bactériennes en conditions de stress définies, préparer et expédier les échantillons pour le séquençage des ARN,
• Collecter, traiter et analyser les données de transcriptomique après séquençage avec l’aide d’un enseignant-chercheur,
• Contribuer au fonctionnement collectif des laboratoires d’accueil (Dynamicure et ABTE équipe MALIM)

Profil recherché

Catégorie d'emploi :

A

Diplôme minimal requis :

BAC + 5 en Microbiologie ou équivalent

Compétences Requises

Compétences principales :

• réaliser des expérimentations de microbiologie et biologie moléculaire,
• analyser des données génomiques et transcriptomiques,
• rédiger des rapports d’essai et des publications

Connaissances

• bactériologie générale,
• bactériologie clinique et/ou alimentaire,
• génomique,
• transcriptomique,
• bonnes pratiques de laboratoire

Compétences Opérationnelles

• manipulateur/trice expérimenté.e en microbiologie classique (cultures, isolements, etc.),
• manipulation des microorganismes de niveau de sécurité 2, biologie moléculaire (extraction d’acides nucléiques), usage d’outils de bioinformatique,
• maîtrise de la communication écrite en anglais scientifique

Compétences Comportementales

• autonomie,
• rigueur,
• aptitude au travail en équipe

Conditions De Recrutement

Recrutement sur contrat de recherche, sous réserve de la disponibilité du financement.

Poste à temps complet, ouvert uniquement aux contractuels (CDD).

Rémunération statutaire et appréciée en fonction de l’expérience professionnelle.

A compétences égales, priorité aux travailleurs handicapés et autres bénéficiaires de l’obligation d’emploi.

Poste à pourvoir : à partir de décembre 2026 jusqu'au 29/02/2028

Date limite de candidature : avant le 24.10.2026

• une lettre de motivation
• un curriculum vitae

Qui sommes-nous ?

L’université de Caen Normandie (UNICAEN) est un acteur majeur et un moteur de développement de l’enseignement supérieur et de la recherche en Normandie. UNICAEN est membre de la communauté d’universités et d’établissements Normandie Université.

Pluridisciplinaire, elle accueille plus de 33 000 étudiants au sein de 12 composantes (UFR, écoles, instituts ).

Afin de mener ces missions, elle s’appuie sur 2 700 professionnels, dont 1 600 personnels enseignants (1 060 enseignant.es-chercheur.ses et 540 enseignant.es) et 1 100 personnels des bibliothèques, ingénieur.es, administratif.ves, techniques, sociaux et de santé (BIATSS).

Descriptif du service

Le poste est à pourvoir dans les unités de recherche UMR Dynamicure et UR 4651 ABTE de l'Université de Caen Normandie

L’équipe de l'UMR Dynamicure est composée d’enseignants chercheurs hospitalo-universitaires de Caen et de Rouen exerçant dans des disciplines liées à l’infectiologie et à l’étude des agents pathogènes.

L’unité de recherche ABTE a été créée en 2012 sous la double tutelle des universités de Caen et de Rouen. Son programme scientifique porte sur la qualité des aliments et des environnements et leurs impacts sur la santé humaine.

À propos de l'offre

• Susceptible d'être vacant à partir du 01/12/2026
• Experte / Expert en biologie - SVT