Ingénieur·e données MS/MS — élucidation structurale (Télétravail)

CEA; Saclay; Hybride; EUR 45 000 - 75 000; Plein temps

Avantages offerts par ce poste

Télétravail

Restaurant d’entreprise

Transports pris en charge 75%

Navettes depuis Paris

CE riche en avantages

Résumé du poste

Le CEA à Saclay recherche un ingénieur·e des données pour développer des workflows haute débit en spectrométrie de masse et contribuer à l’élucidation structurale des petites molécules. Vous participerez à la création de bases de données MS/MS et à leur diffusion auprès de la communauté scientifique.

Cette mission s’inscrit dans l’infrastructure MetaboHUB et le projet e-Lucid, avec une collaboration étroite avec les chimistes et les développeurs IA, et des possibilités de télétravail.

Qualifications

• Vous êtes titulaire d'un diplôme d'ingénieur ou d'un master 2 en informatique et vous avez une spécialisation en sciences des données.
• Vous avez une solide formation en programmation Python, en traitement des données, en gestion de workflow (e.g., Nextflow, Galaxy) et en bases de données (e.g., PostgreSQL).
• Vous avez si possible une expérience des données de spectrométrie de masse MS/MS.
• Vous aimez le travail d'équipe en interaction étroite avec les développeurs en IA et les expérimentateurs chimiques.

Responsabilités

• Développer des workflows pour planifier les acquisitions, rechercher les métadonnées et traiter les spectres.
• Indexer, harmoniser et formater les données dans des bases pour l'entraînement IA.
• Diffuser les bases et les librairies logicielles dans un cadre FAIR auprès de la communauté.

Connaissances

Python programming

Data processing

Workflow management

PostgreSQL

Formation

Diplôme d'ingénieur ou Master 2 en informatique

Outils

Nextflow

Galaxy

PostgreSQL

Description du poste

Le CEA à Saclay recherche un ingénieur·e des données pour développer des workflows haute débit en spectrométrie de masse et contribuer à l’élucidation structurale des petites molécules. Vous participerez à la création de bases de données MS/MS et à leur diffusion auprès de la communauté scientifique.

Cette mission s’inscrit dans l’infrastructure MetaboHUB et le projet e-Lucid, avec une collaboration étroite avec les chimistes et les développeurs IA, et des possibilités de télétravail.