Data scientist - secteur développement durable projet CEDRE F/H

Brief IA; Marseille; On-site; EUR 45,000 - 65,000; Full time

Job summary

Brief IA recherche un(e) chargé(e) de missions IA sur le campus et en laboratoires pour concevoir et optimiser des modèles d'IA appliqués à des données d'imagerie et de biologie moléculaire. Vous intégrerez une équipe pluridisciplinaire et travaillerez sur des projets prioritaires.

Vous développerez des pipelines de prétraitement, rendez les modèles interprétables et documenterez méthodes et données pour assurer reproductibilité et transfert vers les équipes de recherche.

Responsibilities

• Concevoir, entraîner et valider des modèles d'IA pour classifier et prédire dans des données scientifiques complexes.
• Développer des pipelines de prétraitement robustes pour nettoyer et structurer de grands volumes de données issues de l'imagerie et du séquençage.
• Rendre les modèles interprétables (XAI) et croiser les résultats avec les connaissances du domaine.
• Documenter méthodologie, données et code pour assurer reproductibilité et transfert vers les équipes de recherche.
• Nettoyer et structurer les données de séquençage et d'imagerie.
• Développer des pipelines pour grands volumes de données biologiques et d'imagerie.
• Concevoir et entraîner des modèles hybrides et utiliser des algorithmes de classification, détection d’anomalies et clustering.
• Identifier des modifications inédites dans les ADN/ARN viraux et prédire de nouvelles protéines.
• Développer des outils d’analyse automatique de clichés de MEB.
• Visualiser et expliquer les sorties des modèles et croiser les résultats biologiques et prédictifs.

Job description

RESPONSABILITÉS :

Un comité composé de CEDRE et CISAM + définira les délais de réalisation des tâches affectées à l'agent, ses projets prioritaires à traiter et supervisera leur bonne réalisation.

Missions et activités principales

Missions

• Concevoir, entraîner et valider des modèles d'IA (deep learning, modèles hybrides) pour classifier, prédire et identifier des motifs inédits dans des données scientifiques complexes


• Développer des pipelines de prétraitement robustes et reproductibles pour nettoyer, formater et structurer de grands volumes de données issues de l'imagerie et du séquençage


• Rendre les modèles interprétables (XAI) et croiser les résultats prédictifs avec les connaissances du domaine pour guider la recherche expérimentale


• Documenter rigoureusement les méthodes, les données et les codes pour assurer la reproductibilité des analyses et faciliter leur transfert aux équipes de recherche

Activités principales

Prétraitement et structuration des données :

• Nettoyer, formater et structurer les données issues de séquençage et d'imagerie électronique


• Développer des pipelines adaptés aux grands volumes de données biologiques et d'imagerie

Modélisation et apprentissage automatique :

• Concevoir et entraîner des modèles hybrides (deep learning + règles bioinformatiques ou physiques)


• Appliquer des algorithmes de classification, détection d'anomalies et de clustering

Analyse et Découverte :

• Identifier des modifications inédites dans les ADN/ARN viraux et prédire de nouvelles protéines


• Développer des outils d'analyse automatique de clichés de microscopie électronique à balayage (MEB)

Exploration et interprétation des résultats :

• Visualiser et expliquer les sorties des modèles (XAI, SHAP, etc.)


• Croiser les résultats biologiques, structuraux et prédictifs pour guider les hypothèses scientifiques

Conditions d'exercice

Son temps de travail sera réparti entre le campus de St Jerome (CEDRE) et ses laboratoires/instituts d'intervention, au sein des aut