Wissenschaftliche:r Angestellte:r Junior (all genders)

Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE)

Hamburg

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TVöD/VKA Vergütung nach Tarifvertrag
UKE Akademie für Weiterbildung
Deutschlandticket Zuschuss
Gesundheits- und Präventionsangebote
Kinderbetreuung & Familienservice
Restaurant auf dem Gelände

Résumé du poste

Das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) sucht für das Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum eine wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (PhD/Postdoc) im Bereich Computational Pediatric Oncology. Die Position ist am 01.01.2027 zu besetzen, mit der Aussicht auf Promotion.

Sie entwickeln ML-basiertes Klassifikations-Framework basierend auf hochdimensionalen Omics-Daten (DNA-Methylierung) und arbeiten eng mit Partnern im Machine-Learning-Umfeld zusammen.

Qualifications

  • Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in relevanten Bereichen.
  • Fundierte Kenntnisse aktueller Methoden des maschinellen Lernens.
  • Nachgewiesene Programmiererfahrung in Python und ML-Frameworks sind vorteilhaft.
  • Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeit und interdisziplinäre Zusammenarbeit.

Responsabilités

  • Entwicklung und Evaluierung klinisch relevanter ML-Klassifikationsalgorithmen auf Basis Omics-Daten.
  • Enge Zusammenarbeit mit Kooperationspartnern im Bereich Machine Learning und weiteren Forschungsgruppen.
  • Präsentation der Forschungsergebnisse auf internationalen Konferenzen und Veröffentlichung als Erstautor:in.

Connaissances

Python
ML frameworks
R
Kommunikation
Englischkenntnisse

Formation

Wissenschaftliches Hochschulstudium im Bereich Maschinelles Lernen / Bioinformatik / Informatik

Outils

Git
Unix/Linux

Description du poste

Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) – und stehen für exzellente Kompetenz in Forschung, Lehre und der vollumfänglichen Gesundheitsversorgung in unseren Kliniken. Unsere rund 17.000 Mitarbeiter:innen streben jeden Tag aufs Neue danach, mit ihrem Beitrag die Welt ein bisschen gesünder zu machen.

Es ist unser Anspruch, eine der führenden Universitätskliniken zu sein – und gleichzeitig der beste Arbeitgeber unserer Branche.

So glauben wir im UKE fest daran, dass erfolgreiches und erfüllendes Arbeiten im Einklang mit den persönlichen Bedürfnissen und individuellen Lebensentwürfen der Mitarbeitenden stehen sollte. Und so unterschiedlich diese sind, so vielfältig ist unser Angebot an individuellen Lösungen.

Willkommen im UKE.

Wissenschaftliche:r Angestellte:r Junior (all genders) - Computational Pediatric Oncology - Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum

Das macht die Position aus

Am Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum am Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf ist in der Arbeitsgruppe Computational Pediatric Oncology (Leitung Prof. Dr. Michael Bockmayr) zum 01.01.2027 eine Stelle als wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (PhD/Postdoc) zu besetzen. Ein späterer Eintritt ist prinzipiell denkbar. Es besteht die Möglichkeit zur Promotion.

Die Arbeitsgruppe widmet sich der Entwicklung quantitativer Methoden für die pädiatrische Hämatologie und Onkologie. Sie erwartet ein spannendes Projekt, bei dem Methoden des maschinellen Lernens genutzt werden, um aus hochdimensionalen Omics-Daten, insbesondere DNA-Methylierungsdaten, genauere Vorhersagen zu Diagnose, Prognose und Therapieansprechen bei Krebserkrankungen zu ermöglichen.

Eine professionelle und individuelle Betreuung wird über den gesamten Zeitraum gewährleistet. Darüber hinaus erwartet Sie im Forschungsinstitut ein motiviertes und dynamisches Team aus Ärzt:innen, Naturwissenschaftler:innen, Bioinformatiker:innen, technischen Assistent:innen und Studierenden, die im Rahmen unterschiedlicher Projekte und Ansätze der Erforschung kindlicher Krebserkrankungen auf der Spur sind.

Ihre Aufgaben:

  • Entwicklung und Evaluierung klinisch relevanter Klassifikationsalgorithmen mit Methoden des maschinellen Lernens auf Basis von hochdimensionalen Omics-Datensätzen
  • Enge Zusammenarbeit mit Kooperationspartner:innen im Bereich Machine Learning und weiteren Forschungsgruppen am Kinderkrebszentrum
  • Präsentation der Forschungsergebnisse auf internationalen Konferenzen und Veröffentlichung als Erstautor:in in anerkannten Fachzeitschriften

Die Position ist drittmittel- und projektbedingt auf zwei Jahre befristet mit der Option auf Verlängerung.

Darauf freuen wir uns

  • Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium im Bereich Maschinelles Lernen, Bioinformatik, Informatik, Data Science, Angewandte Mathematik, Physik, Biomedical Engineering oder einem anderen relevanten Studiengang
  • Nachgewiesene Programmiererfahrung in Python, gute Kenntnisse von ML-Frameworks wie PyTorch oder Programmierkenntnisse in R sind vorteilhaft.
  • Fundierte Kenntnisse aktueller Methoden des maschinellen Lernens
  • Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeit und Fähigkeit zur interdisziplinären Zusammenarbeit
  • Sichere Englischkenntnisse in Wort und Schrift, Deutschkenntnisse sind vorteilhaft.
  • Vorerfahrungen mit Representation-Learning, Transformer-Architekturen, Foundation Models und erklärbarer KI (xAI) sind vorteilhaft.
  • Kenntnisse zur Verarbeitung von DNA-Methylierungsdaten, insbesondere Array- und (Nanopore-) sequenzierungsbasiert, sind vorteilhaft, aber nicht erforderlich. Für uns zählen vor allem Ihre fundierten Programmier- und ML-Kenntnisse.
  • Kenntnisse im Umgang mit UNIX-basierten Betriebssystemen und Versionskontrollsoftware sind wünschenswert.

Immunitätsstatus

Eine Einstellung ist nur möglich, wenn nach den jeweils geltenden (gesetzlichen und medizinischen) Vorgaben gegen das Masernvirus ein vollständiger Immunisierungs- bzw. Immunitätsnachweis vorliegt. Dies ist vor Beschäftigungsbeginn durch entsprechende Unterlagen (z. B. Impfausweis) nachzuweisen.

Das bieten wir

  • Faire und transparente Vergütung nach unserem TarifvertragTVöD/VKA (63.600 € - 91.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufserfahrung. Die Gehaltsangabe bezieht sich auf eine Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden. Die genannten Beträge sind Richtwerte und stellen kein Gehaltsversprechen dar.
  • Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld
  • Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unsererUKE-Akademie für Bildung und Karriere
  • Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
  • Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice
  • Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
  • Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
  • Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
  • Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
  • Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände
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