Softwareentwickler:in / Research Software Engineer (m/w/d) für medizinische Bildgebungs- und Analyse

Deutsches Krebsforschungszentrum; Heidelberg; On-site; EUR 65,000 - 90,000; Full time

Benefits offered by this job

30 Tage Urlaub

Flexible Arbeitszeiten

Vergütung nach TV-L inkl. betrieblichr

Job summary

Das Deutsche Krebsforschungszentrum (DKFZ) in Heidelberg sucht ab Januar 2027 eine:n motivierte:n Softwareentwickler:in / Research Software Engineer (m/w/d) für medizinische Bildgebungs- und Analyseplattformen.

Sie arbeiten an der verteilten Infrastruktur, integrieren KI-Methoden und betreiben containerisierte Anwendungen in einer Kubernetes-basierten Umgebung. Bewerberinnen und Bewerber mit starkem Fokus auf robuste Softwareentwicklung und plattformgebundenem Betrieb sind willkommen.

Qualifications

• Masterstudium in Informatik, Medizininformatik, Data Science, Mathematik, Physik, Ingenieurwissenschaften oder verwandtem Fachgebiet
• Praktische Erfahrung in Softwareentwicklung, Forschungssoftware, Plattformbetrieb, DevOps oder medizinischer IT
• Erfahrung in mindestens einer der Programmiersprachen Python oder JavaScript/TypeScript
• Praxis in Linux sowie modernen Container- und Cloud-Technologien, insbesondere Docker/Podman, OCI-Container, Kubernetes oder Helm
• Fähigkeit, technische Probleme strukturiert zu analysieren, zu dokumentieren und mit Partnern zu lösen
• Technische Kommunikation, Support und Abstimmung mit Standorten und Projektpartnern
• Sorgfältige, zuverlässige Arbeitsweise und Teamfähigkeit
• Sichere Deutschkenntnisse mindestens C1 sowie gute Englischkenntnisse

Responsibilities

• Weiterentwicklung unserer Plattformen durch Softwareentwicklung im Open-Source-Toolkit Kaapana
• Integration, Bereitstellung und Pflege von KI-Methoden und Analysen-Workflows
• Unterstützung der Migration von Methoden in die Infrastruktur an Standorten
• Softwaretechnische Integration von Werkzeugen zur Verarbeitung multimodaler medizinischer Daten
• Technische Unterstützung multizentrischer Forschungsprojekte und klinischer Studien
• Betrieb, Wartung, Monitoring und Fehleranalyse der Plattform-Instanzen
• Second-Level-Support für IT-Ansprechpersonen und lokale IT-Teams
• Dokumentation, Betriebsanleitungen und Support-Materialien erstellen und pflegen
• Teilnahme an Meetings, technischen Abstimmungen und Workshops
• Präsentation der Plattform bei Veranstaltungen und Projekttreffen

Job description

Das Deutsche Krebsforschungszentrum (DKFZ) ist eines der größten Krebsforschungszentren Europas. „Forschen für ein Leben ohne Krebs“ ist unsere Mission und hierfür arbeiten unsere Weltklassewissenschaftler:innen gemeinsam mit allen Mitarbeitenden.

Wir erforschen, wie Krebs entsteht, erfassen Krebsrisikofaktoren und suchen nach neuen Strategien, die verhindern, dass Menschen an Krebs erkranken. Wir entwickeln neue Methoden, mit denen Tumore präziser diagnostiziert und Krebspatient:innen erfolgreicher behandelt werden können.Jeder Beitrag zählt– ob in der Forschung, in der Administration oder der Infrastruktur. Das macht unsere tägliche Arbeit so bedeutungsvoll und spannend.

Die Abteilung "Medizinische Bildverarbeitung" (Medical Image Computing – MIC) entwickelt Methoden und Softwarelösungen an der Schnittstelle von medizinischer Bildgebung, künstlicher Intelligenz, Cloud-Technologien und moderner Forschungsinfrastruktur.

Für den Betrieb und die Weiterentwicklung unserer verteilten Bildgebungs- und Analyseplattformen suchen wir ab Januar 2027 eine:n motivierte:n Softwareentwickler:in / Research Software Engineer (m/w/d) für medizinische Bildgebungs- und Analyseplattformen.

Unsere Plattformen basieren auf dem Open-Source-Toolkit Kaapana, einer Kubernetes-basierten Plattform für medizinische Datenanalyse, KI-Workflows sowie föderierte Analyse- und Lernszenarien. Auf dieser gemeinsamen technischen Basis betreiben wir mehrere standortübergreifende Forschungsinfrastrukturen, die lokale Instanzen an den beteiligten Standorten mit zentralen Komponenten verbinden. Zwei aktuelle Beispiele: RACOON (Radiological Cooperative Network) ist die bundesweite Bildgebungsplattform des Netzwerks Universitätsmedizin (NUM). RACOON verbindet lokale Standorte an den deutschen Universitätskliniken mit zentralen Komponenten in RACOON-CENTRAL und unterstützt multizentrische Forschungsprojekte, klinische Studien, strukturierte Befundung, Annotation, KI-gestützte Bildanalyse und die standardisierte Nachnutzung radiologischer Daten. RACOON-AI ist die zentrale KI-Plattform innerhalb dieser Infrastruktur. NCT IDAI (Image Data and Analysis Infrastructure for NCT) stellt die gemeinsame Bildgebungs- und Analyseinfrastruktur für das Nationale Centrum für Tumorerkrankungen bereit und verbindet die NCT-Standorte für standortübergreifende onkologische Forschung.

Die technischen Aufgaben sind in beiden Infrastrukturen ähnlich. Im Wesentlichen unterscheiden sich die angebundenen Standorte und die fachlichen Anwendungsfälle. Ihr Schwerpunkt ergibt sich aus Ihrem Profil und dem Projektbedarf.

Wichtiger Hinweis zum Profil der Stelle:

Diese Position ist keine Data-Science-, Modelltraining- oder Promotionsstelle. Der Schwerpunkt liegt auf robuster Softwareentwicklung, Plattformbetrieb, Methodenintegration, Support und technischer Koordination innerhalb produktiv genutzter, standortübergreifender medizinischer Forschungsinfrastrukturen.

Ihre Aufgaben:

• Weiterentwicklung unserer Plattformen durch Softwareentwicklung im Open-Source-Toolkit Kaapana
• Integration, Bereitstellung und Pflege von KI-Methoden, Analyse-Workflows und containerisierten Anwendungen
• Unterstützung der Methodentranslation aus dem Medical Image Computing in die Infrastruktur an den beteiligten Standorten
• Softwaretechnische Integration von Werkzeugen und Konzepten zur Verarbeitung multimodaler medizinischer Daten, einschließlich Bilddaten, strukturierter klinischer Daten und weiterer forschungsrelevanter Datenquellen
• Technische Unterstützung multizentrischer Forschungsprojekte, klinischer Studien und medizinischer Use Cases
• Betrieb, Wartung, Monitoring und Fehleranalyse der lokalen und zentralen Plattform-Instanzen
• Second-Level-Support für IT-Ansprechpersonen und lokale IT-Teams an den angebundenen Standorten
• Weiterentwicklung und Wartung von Plattformkomponenten im Umfeld von Kubernetes, Helm, Docker/Podman, Apache Airflow, OpenSearch, dcm4chee, S3, Keycloak, Prometheus/Grafana und webbasierten Nutzeroberflächen
• Erstellung und Pflege technischer Dokumentation, Betriebsanleitungen und Support-Materialien
• Teilnahme an Projektmeetings, technischen Abstimmungen und Workshops
• Präsentation der Plattform bei Veranstaltungen, Vernetzungsformaten und Projekttreffen
• Mitwirkung an Reporting, Planung und technischer Koordination

Ihr Profil:

Sie passen besonders gut zu uns, wenn Sie Freude an robuster Forschungssoftware, verteilten Infrastrukturen und der Zusammenarbeit mit klinischen, wissenschaftlichen und technischen Partnern haben.

Zwingend erforderlich sind:

• Abgeschlossenes Masterstudium in Informatik, Medizininformatik, Data Science, Mathematik, Physik, Ingenieurwissenschaften oder einem verwandten wissenschaftlich-technischen Fachgebiet
• Praktische Erfahrung in Softwareentwicklung, Forschungssoftware, Plattformbetrieb, DevOps oder medizinischer IT
• Erfahrung in mindestens einer der Programmiersprachen Python oder JavaScript/TypeScript
• Praktische Erfahrung mit Linux sowie modernen Container- und Cloud-Technologien, insbesondere Docker/Podman, OCI-Containern, Kubernetes oder Helm
• Fähigkeit, technische Probleme strukturiert zu analysieren, nachvollziehbar zu dokumentieren und gemeinsam mit internen und externen Partnern zu lösen
• Bereitschaft zur technischen Kommunikation, zum Support und zur Abstimmung mit den beteiligten Standorten und Projektpartnern
• Sorgfältige, zuverlässige und strukturierte Arbeitsweise
• Teamfähigkeit in einem interdisziplinären, standortübergreifenden Projektumfeld
• Verhandlungssichere Deutschkenntnisse mindestens auf C1-Niveau, da ein wesentlicher Teil der Tätigkeit aus deutschsprachiger Kommunikation, Support und technischer Abstimmung mit den Standorten und Projektpartnern besteht
• Sehr gute Englischkenntnisse für die Arbeit in einem internationalen wissenschaftlichen und Open-Source-Umfeld

Von Vorteil sind:

• Erfahrung mit Apache Airflow, OpenSearch, dcm4chee, S3, Keycloak, Prometheus, Grafana oder vergleichbaren Infrastrukturkomponenten
• Erfahrung mit webbasierten UI-Frameworks wie Vue, React oder Svelte
• Kenntnisse in CI/CD, GitOps, Monitoring, Logging, REST-APIs oder verteilten Plattformen
• Kenntnisse im Betrieb verteilter IT-Infrastrukturen, insbesondere Netzwerkkonfiguration, DNS, TLS-/SSL-Zertifikate, Reverse Proxies, Firewalls, VPN, Proxy-Setups oder Zugriffskontrolle in klinischen bzw. institutionellen IT-Umgebungen
• Erfahrung mit DICOM, PACS-Systemen, FHIR, medizinischen Bilddaten oder klinischen Forschungsdaten
• Erfahrung in Machine Learning, Image Computing, High-Performance Computing oder föderierten Analyse- und Lernszenarien
• Erfahrung mit multizentrischen Forschungsprojekten, klinischen Studien oder medizinischen Forschungsdateninfrastrukturen
• Erfahrung in Open-Source-Softwareentwicklung, technischer Dokumentation, Support-Prozessen oder Schulung technischer Anwender:innen

Was die Stelle besonders macht:

Mitarbeit an standortübergreifenden Forschungsinfrastrukturen mit hoher Relevanz für medizinische Bildgebung, KI und datengetriebene klinische Forschung

Arbeit an zentralen Plattformen für multizentrische Forschungsprojekte und klinische Studien, von der bundesweiten Radiologie-Plattform des NUM bis zur onkologischen Forschungsinfrastruktur des NCT

Möglichkeit, innovative Methoden aus dem Medical Image Computing in die Infrastruktur deutscher Universitätskliniken und Krebszentren zu bringen

Arbeit an einer modernen, containerisierten Open-Source-Plattform auf Basis von Kaapana

Ein interdisziplinäres Umfeld mit Expert:innen aus Informatik, medizinischer Bildgebung, KI, Radiologie, Onkologie und Forschungsdatenmanagement

Gestaltungsspielraum bei der Weiterentwicklung produktiv eingesetzter Forschungsplattformen

Ein dynamisches Arbeitsumfeld an der Schnittstelle von Forschung, Softwareentwicklung, Plattformbetrieb, Support und klinischer Anwendung

Unser Angebot:

• Hervorragende Rahmenbedingungen: modernste state-of-the-art Infrastruktur und Möglichkeit zum internationalen Austausch auf Spitzenniveau
• 30 Tage Urlaub
• Flexible Arbeitszeiten
• Vergütung nach TV-L inkl. betrieblicher Altersvorsorge und vermögenswirksamer Leistungen
• Möglichkeit zur mobilen Arbeit und Teilzeitarbeit
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld
• Nachhaltig zur Arbeit: Vergünstigtes Deutschland-Jobticket
• Entfalten Sie Ihr volles Potenzial: gezielte Angebote für Ihre persönliche Entwicklung fördern Ihre Talente
• Unser betriebliches Gesundheitsmanagement bietet ein ganzheitliches Angebot für Ihr Wohlbefinden

Ihre Ansprechperson:

Dr. Peter Neher

Telefon: [phone]

Befristung: Die Stelle ist zunächst auf 2 Jahre befristet. Eine Verlängerung ist möglich.

Bewerbungsschluss: 20.11.2026