Softwareentwickler:in / Research Software Engineer (m/w/d) für medizinische Bildgebungs- und Analyseplattformen

Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ) - Stiftung des öff. Rechts; Heidelberg; On-site; EUR 60,000 - 85,000; Full time

Benefits offered by this job

30 Tage Urlaub

TV-L Vergütung inkl. betrieblicher Be-

Deutschland-Jobticket

Familienfreundliches Arbeitsumfeld

Job summary

dkfz. Deutsches Krebsforschungszentrum sucht zum 01/2027 eine:n Softwareentwickler:in / Research Software Engineer zur Weiterentwicklung einer verteilten medizinischen Bildgebungs- und Analyseplattform.

Schwerpunkt liegt auf robuster Softwareentwicklung, Plattformbetrieb, Methodenintegration und technischer Koordination über Standorte. Sie arbeiten mit Linux, Docker/Podman, Kubernetes und Kaapana in einer interdisziplinären, internationalen Forschungsumgebung.

Qualifications

• Abgeschlossenes Masterstudium in Informatik, Medizininformatik, Data Science, Mathematik, Physik, Ingenieurwissenschaften oder verwandtem Fachgebiet.
• Praktische Erfahrung in Softwareentwicklung, Plattformbetrieb, DevOps oder medizinischer IT.
• Praxis in Linux, Container- bzw. Cloud-Technologien (Docker/Podman, Kubernetes, Helm).
• Fähigkeit zur strukturierten Problemanalyse, Dokumentation und interner/externer Koordination.
• Gute Deutschkenntnisse (mind. C1) und sehr gute Englischkenntnisse für internationales Umfeld.

Responsibilities

• Weiterentwicklung der Plattformen durch Softwareentwicklung im Open-Source-Toolkit Kaapana.
• Integration, Bereitstellung und Pflege von KI-Methoden, Analytik-Workflows und containerisierten Anwendungen.
• Unterstützung der Translation von Methoden in die Infrastruktur an Standorten.
• Technische Integration von Werkzeugen zur Verarbeitung multimodaler medizinischer Daten.
• Betrieb, Wartung, Monitoring und Fehleranalyse der Plattform-Instanzen.

Skills

Linux-Grundkenntnisse

Teamfähigkeit

Dokumentation

Education

Masterabschluss in Informatik/Medizinische Informatik/Data Science/Mathematik/Physik/Ingenieurwissenschaften

Tools

Docker/Podman

Kubernetes

Helm

Apache Airflow

OpenSearch

dcm4chee

S3

Keycloak

Prometheus/Grafana

Job description

Softwareentwickler:in / Research Software Engineer (m/w/d) für medizinische Bildgebungs- und Analyseplattformen

Das Deutsche Krebsforschungszentrum (DKFZ) ist eines der größten Krebsforschungszentren Europas. „Forschen für ein Leben ohne Krebs“ ist unsere Mission und hierfür arbeiten unsere Weltklassewissenschaftler:innen gemeinsam mit allen Mitarbeitenden.

Wir erforschen, wie Krebs entsteht, erfassen Krebsrisikofaktoren und suchen nach neuen Strategien, die verhindern, dass Menschen an Krebs erkranken. Wir entwickeln neue Methoden, mit denen Tumore präziser diagnostiziert und Krebspatient:innen erfolgreicher behandelt werden können.Jeder Beitrag zählt– ob in der Forschung, in der Administration oder der Infrastruktur. Das macht unsere tägliche Arbeit so bedeutungsvoll und spannend.

Die Abteilung "Medizinische Bildverarbeitung" (Medical Image Computing – MIC) entwickelt Methoden und Softwarelösungen an der Schnittstelle von medizinischer Bildgebung, künstlicher Intelligenz, Cloud-Technologien und moderner Forschungsinfrastruktur.

Für den Betrieb und die Weiterentwicklung unserer verteilten Bildgebungs- und Analyseplattformen suchen wir ab Januar 2027 eine:n motivierte:n

Unsere Plattformen basieren auf dem Open-Source-Toolkit Kaapana, einer Kubernetes-basierten Plattform für medizinische Datenanalyse, KI-Workflows sowie föderierte Analyse- und Lernszenarien. Auf dieser gemeinsamen technischen Basis betreiben wir mehrere standortübergreifende Forschungsinfrastrukturen, die lokale Instanzen an den beteiligten Standorten mit zentralen Komponenten verbinden. Zwei aktuelle Beispiele:
RACOON (Radiological Cooperative Network) ist die bundesweite Bildgebungsplattform des Netzwerks Universitätsmedizin (NUM). RACOON verbindet lokale Standorte an den deutschen Universitätskliniken mit zentralen Komponenten in RACOON-CENTRAL und unterstützt multizentrische Forschungsprojekte, klinische Studien, strukturierte Befundung, Annotation, KI-gestützte Bildanalyse und die standardisierte Nachnutzung radiologischer Daten. RACOON-AI ist die zentrale KI-Plattform innerhalb dieser Infrastruktur.
NCT IDAI (Image Data and Analysis Infrastructure for NCT) stellt die gemeinsame Bildgebungs- und Analyseinfrastruktur für das Nationale Centrum für Tumorerkrankungen bereit und verbindet die NCT-Standorte für standortübergreifende onkologische Forschung.
Die technischen Aufgaben sind in beiden Infrastrukturen ähnlich. Im Wesentlichen unterscheiden sich die angebundenen Standorte und die fachlichen Anwendungsfälle. Ihr Schwerpunkt ergibt sich aus Ihrem Profil und dem Projektbedarf.
Wichtiger Hinweis zum Profil der Stelle:
Diese Position ist keine Data-Science-, Modelltraining- oder Promotionsstelle. Der Schwerpunkt liegt auf robuster Softwareentwicklung, Plattformbetrieb, Methodenintegration, Support und technischer Koordination innerhalb produktiv genutzter, standortübergreifender medizinischer Forschungsinfrastrukturen.
Die Stelle richtet sich an Bewerber:innen, die Forschungssoftware in nutzbare Plattformkomponenten überführen, containerisierte Dienste betreiben, KI-Methoden in reproduzierbare Workflows integrieren und technische Fragestellungen gemeinsam mit den beteiligten Standorten, deren IT-Teams und Projektpartnern lösen möchten.

Ihre Aufgaben:

• Weiterentwicklung unserer Plattformen durch Softwareentwicklung im Open-Source-Toolkit Kaapana
• Integration, Bereitstellung und Pflege von KI-Methoden, Analyse-Workflows und containerisierten Anwendungen
• Unterstützung der Methodentranslation aus dem Medical Image Computing in die Infrastruktur an den beteiligten Standorten
• Softwaretechnische Integration von Werkzeugen und Konzepten zur Verarbeitung multimodaler medizinischer Daten, einschließlich Bilddaten, strukturierter klinischer Daten und weiterer forschungsrelevanter Datenquellen
• Technische Unterstützung multizentrischer Forschungsprojekte, klinischer Studien und medizinischer Use Cases
• Betrieb, Wartung, Monitoring und Fehleranalyse der lokalen und zentralen Plattform-Instanzen
• Second-Level-Support für IT-Ansprechpersonen und lokale IT-Teams an den angebundenen Standorten
• Weiterentwicklung und Wartung von Plattformkomponenten im Umfeld von Kubernetes, Helm, Docker/Podman, Apache Airflow, OpenSearch, dcm4chee, S3, Keycloak, Prometheus/Grafana und webbasierten Nutzeroberflächen
• Erstellung und Pflege technischer Dokumentation, Betriebsanleitungen und Support-Materialien
• Teilnahme an Projektmeetings, technischen Abstimmungen und Workshops
• Präsentation der Plattform bei Veranstaltungen, Vernetzungsformaten und Projekttreffen
• Mitwirkung an Reporting, Planung und technischer Koordination

Sie passen besonders gut zu uns, wenn Sie Freude an robuster Forschungssoftware, verteilten Infrastrukturen und der Zusammenarbeit mit klinischen, wissenschaftlichen und technischen Partnern haben.

Zwingend erforderlich sind:

• Abgeschlossenes Masterstudium in Informatik, Medizininformatik, Data Science, Mathematik, Physik, Ingenieurwissenschaften oder einem verwandten wissenschaftlich-technischen Fachgebiet
• Praktische Erfahrung in Softwareentwicklung, Forschungssoftware, Plattformbetrieb, DevOps oder medizinischer IT
• Praktische Erfahrung mit Linux sowie modernen Container- und Cloud-Technologien, insbesondere Docker/Podman, OCI-Containern, Kubernetes oder Helm
• Fähigkeit, technische Probleme strukturiert zu analysieren, nachvollziehbar zu dokumentieren und gemeinsam mit internen und externen Partnern zu lösen
• Bereitschaft zur technischen Kommunikation, zum Support und zur Abstimmung mit den beteiligten Standorten und Projektpartnern
• Sorgfältige, zuverlässige und strukturierte Arbeitsweise
• Teamfähigkeit in einem interdisziplinären, standortübergreifenden Projektumfeld
• Verhandlungssichere Deutschkenntnisse mindestens auf C1-Niveau, da ein wesentlicher Teil der Tätigkeit aus deutschsprachiger Kommunikation, Support und technischer Abstimmung mit den Standorten und Projektpartnern besteht
• Sehr gute Englischkenntnisse für die Arbeit in einem internationalen wissenschaftlichen und Open-Source-Umfeld

Von Vorteil sind:

• Erfahrung mit Apache Airflow, OpenSearch, dcm4chee, S3, Keycloak, Prometheus, Grafana oder vergleichbaren Infrastrukturkomponenten
• Erfahrung mit webbasierten UI-Frameworks wie Vue, React oder Svelte
• Kenntnisse in CI/CD, GitOps, Monitoring, Logging, REST-APIs oder verteilten Plattformen
• Kenntnisse im Betrieb verteilter IT-Infrastrukturen, insbesondere Netzwerkkonfiguration, DNS, TLS-/SSL-Zertifikate, Reverse Proxies, Firewalls, VPN, Proxy-Setups oder Zugriffskontrolle in klinischen bzw. institutionellen IT-Umgebungen
• Erfahrung mit DICOM, PACS-Systemen, FHIR, medizinischen Bilddaten oder klinischen Forschungsdaten
• Erfahrung in Machine Learning, Image Computing, High-Performance Computing oder föderierten Analyse- und Lernszenarien
• Erfahrung mit multizentrischen Forschungsprojekten, klinischen Studien oder medizinischen Forschungsdateninfrastrukturen
• Erfahrung in Open-Source-Softwareentwicklung, technischer Dokumentation, Support-Prozessen oder Schulung technischer Anwender:innen

Was die Stelle besonders macht:

• Mitarbeit an standortübergreifenden Forschungsinfrastrukturen mit hoher Relevanz für medizinische Bildgebung, KI und datengetriebene klinische Forschung
• Arbeit an zentralen Plattformen für multizentrische Forschungsprojekte und klinische Studien, von der bundesweiten Radiologie-Plattform des NUM bis zur onkologischen Forschungsinfrastruktur des NCT
• Möglichkeit, innovative Methoden aus dem Medical Image Computing in die Infrastruktur deutscher Universitätskliniken und Krebszentren zu bringen
• Arbeit an einer modernen, containerisierten Open-Source-Plattform auf Basis von Kaapana
• Ein interdisziplinäres Umfeld mit Expert:innen aus Informatik, medizinischer Bildgebung, KI, Radiologie, Onkologie und Forschungsdatenmanagement
• Gestaltungsspielraum bei der Weiterentwicklung produktiv eingesetzter Forschungsplattformen
• Ein dynamisches Arbeitsumfeld an der Schnittstelle von Forschung, Softwareentwicklung, Plattformbetrieb, Support und klinischer Anwendung

Unser Angebot:

30 Tage Urlaub

Vergütung nach TV-L inkl. betrieblicher Altersvorsorge und vermögenswirksamer Leistungen

Familienfreundliches Arbeitsumfeld

Nachhaltig zur Arbeit: Vergünstigtes Deutschland-Jobticket

Entfalten Sie Ihr volles Potenzial: gezielte Angebote für Ihre persönliche Entwicklung fördern Ihre Talente

Unser betriebliches Gesundheitsmanagement bietet ein ganzheitliches Angebot für Ihr Wohlbefinden

Sie sind interessiert?

Dann werden auch Sie Teil des DKFZ und tragen gemeinsam mit uns zu einem Leben ohne Krebs bei!

Ihre Ansprechperson:

Ihre Ansprechperson:
Dr.PeterNeher
Telefon:[phone]

Befristung:

Befristung:Die Stelle ist zunächst auf 2 Jahre befristet. Eine Verlängerung ist möglich.

Wir sind davon überzeugt: Ein innovatives Forschungs- und Arbeitsumfeld lebt von der Vielfalt seiner Beschäftigten. Daher freuen wir uns über Bewerbungen von talentierten Menschen, unabhängig von Geschlecht, kulturellem Hintergrund, Nationalität, ethnischer Zugehörigkeit, sexueller Identität, körperlichen Fähigkeiten, Religion und Alter. Menschen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung bevorzugt.

Hinweis:Wir unterliegen den Vorschriften des Infektionsschutzgesetzes (IfSG). Deshalb müssen alle unsere Beschäftigten einen Immunitätsnachweis gegen Masern vorlegen.