Postdoc-Stelle im Bereich computergestützte Metagenomik

Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH (HZI); Braunschweig; Hybrid; EUR 55,000 - 70,000; Full time

Benefits offered by this job

Flexible Arbeitszeiten

Homeoffice

Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten

Jobticket-Zuschuss

Job summary

Das Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung (HZI) in Braunschweig sucht eine Postdoc-Stelle im Bereich computergestützte Metagenomik (m/w/d). Sie arbeiten an der CAMI-Initiative und tragen zur Weiterentwicklung von Benchmarking-Tools bei, während Sie sich in eine interdisziplinäre Forschungsgruppe integrieren.

Sie publizieren Ihre Ergebnisse in Fachzeitschriften, nutzen FAIR-Datenpraktiken und tragen aktiv zur Lehre bzw. Drittmitteleinwerbung bei.

Qualifications

• Promotion in Informatik, Bioinformatik, Statistik, maschinellem Lernen oder vergleichbares Fachgebiet.
• Vorerfahrung mit dem Forschungsthema und Engagement für reproduzierbare Forschung
• Gute Programmierkenntnisse, analytisches Denkvermögen und Problemlösungskompetenz
• Selbstständige, strukturierte und zielorientierte Arbeitsweise sowie Team- und Kommunikationsfähigkeit
• Ausgezeichnete Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Responsibilities

• Entwicklung und Bewertung innovativer Forschungsmethoden im Rahmen der CAMI-Initiative.
• Erweiterung der Benchmarking-Frameworks des CAMI-Portals und der Software zur Benchmark-Auswertung
• Einbindung der Metagenomik-Forschungsgemeinschaft in CAMI-Benchmarking-Aktivitäten
• Mitarbeit in NFDI4Microbiota durch Weiterentwicklung von Benchmarking-Ressourcen und FAIR-Datenpraktiken
• Veröffentlichung der Forschungsergebnisse in Fachzeitschriften und Präsentation auf Konferenzen
• Mitwirkung bei Drittmitteleinwerbung oder Lehraktivitäten (bis zu 25% der Arbeitszeit)

Skills

Programmieren

Analytisches Denken

Problemlösung

Teamfähigkeit

Englischkenntnisse

Education

Promotion in Informatik/Bioinformatik/Statistik/ML

Job description

Stellenausschreibung Nr. 772

Am Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung untersuchen Wissenschaftler:innen die Mechanismen von Infektionskrankheiten und ihrer Abwehr. Die Ergebnisse der Grundlagenforschung entwickeln wir systematisch in Richtung medizinischer Anwendung. Aufgabe des Zentrums ist es, zur Bewältigung der Herausforderungen beizutragen, die Infektionskrankheiten im 21. Jahrhundert an Medizin und Gesellschaft stellen. Das HZI steht für exzellente, verantwortungsvolle und transparente Forschung, Vielfalt, Chancengleichheit, Förderung von Talenten und Vereinbarkeit von Familie und Beruf. Wir gestalten die Forschung wie auch alle unterstützenden Strukturen nach den aktuellen Erfordernissen von Nachhaltigkeit und Entwicklung. Desgleichen legen wir für unsere Mitarbeiter:innen Wert auf hohe Standards in Arbeits,- Gesundheits- und Umweltschutz.

Die Abteilung „Bioinformatik der Infektionsforschung“ unter der Leitung von Prof. Dr. Alice C. McHardy am Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung (HZI) schreibt folgende Stelle aus:

Postdoc-Stelle im Bereich computergestützte Metagenomik (m/w/d)

Als Mitglied der Helmholtz-Gemeinschaft betreibt das Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung mit Sitz in Braunschweig Spitzenforschung auf dem Gebiet der Infektionskrankheiten. Unsere Wissenschaftler:innen entwickeln neuartige Methoden und Strategien, um Infektionskrankheiten schneller und wirksamer zu bekämpfen. Unser gemeinsames Ziel ist es, neue Ansätze zur Prävention, Diagnose und Behandlung von Infektionskrankheiten zu entwickeln. Im Mittelpunkt unserer Forschung stehen bakterielle und virale Krankheitserreger, deren Wechselwirkungen mit dem menschlichen Immunsystem sowie neue wirksame Wirkstoffe und Impfstoffe.

Ihre Aufgaben umfassen unter anderem:

• Entwicklung und Bewertung innovativer Forschungsmethoden im Rahmen der CAMI-Initiative, einschließlich der Erstellung komplexer, realitätsnaher und umfassender Metagenom- und Metatranskriptom-Benchmark-Datensätze
• Erweiterung der Benchmarking-Frameworks des CAMI-Portals sowie der zugehörigen Software zur Benchmark-Auswertung
• Einbindung der breiteren Metagenomik-Forschungsgemeinschaft in die Benchmarking-Aktivitäten von CAMI
• Aktive Mitarbeit in NFDI4Microbiota durch die Weiterentwicklung von nachhaltigen Benchmarking-Ressourcen, Standards der Forschungsgemeinschaft und FAIR-konformen Datenpraktiken
• Veröffentlichung der Forschungsergebnisse in Fachzeitschriften mit Peer-Review-Verfahren sowie Präsentation Ihrer Arbeit auf nationalen und internationalen wissenschaftlichen Tagungen
• Mitwirkung bei der Einwerbung von Drittmitteln oder bei Lehraktivitäten der Abteilung (bis zu 25 % der Arbeitszeit)

Ihre Qualifikationen und Fähigkeiten:

• Abgeschlossene Promotion in Informatik, Bioinformatik, Statistik, maschinellem Lernen oder einem vergleichbaren Fachgebiet
• Vorerfahrung mit dem Forschungsthema und Engagement für reproduzierbare Forschung
• Gute Programmierkenntnisse, ausgeprägtes analytisches Denkvermögen und Problemlösungskompetenz
• Selbstständige, strukturierte und zielorientierte Arbeitsweise sowie Team- und Kommunikationsfähigkeit
• Ausgezeichnete Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Wir bieten Ihnen:

• Eine attraktive und abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsorientierten Forschungsinstitut mit einem internationalen Umfeld am Science Campus Süd in Braunschweig
• Eine hochmoderne Infrastruktur und modernste Technologien
• Flexible Arbeitszeitgestaltung, Teilzeitmodelle sowie Homeoffice
• Eine Unternehmenskultur der Wertschätzung und Förderung der Chancengleichheit
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten zur Entwicklung fachlicher Kenntnisse und persönlicher Fähigkeiten
• Ein Familienbüro zur Unterstützung von Familie und Beruf, sowie Angebote für eine verbesserte Kinderbetreuung bspw. auch in den Ferien
• Interessante Zusatzleistungen des öffentlichen Dienstes
• Möglichkeit eines Arbeitgeberzuschusses zum Jobticket

Bei gleicher fachlicher Eignung erhalten Schwerbehinderte den Vorzug. Um Ihre Rechte zu wahren, bitten wir Sie, uns einen deutlichen Hinweis auf das Vorliegen einer Schwerbehinderung in Ihrem Anschreiben oder Lebenslauf zu geben.

Das HZI engagiert sich aktiv für Gleichstellung, Vielfalt und Integration. Aus diesem Grund verfolgt das HZI das Ziel der beruflichen Gleichstellung von Frauen und Männern. Die Stelle ist teilzeitgeeignet.

Einstellungstermin: Zum nächstmöglichen Zeitpunkt, zunächst befristet zum 31.12.2028

Vergütung: E 13 TV EntGO Bund

Arbeitszeit: 39,00 Stunden pro Woche

Arbeitsort: Braunschweig

Probezeit: 6 Monate

Bewerbungsschluss: 08.11.2026

Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an Dr. Carmen Paulmann, E-Mail: [e-mail].