Biologe/Biologin (m/w/d)

Leibniz-Institut für Gartenbau; Großbeeren; Hybrid; EUR 55,000 - 75,000; Part time

Benefits offered by this job

Flexible Arbeitszeitmodelle

Mobiles Arbeiten bis 50%

VBL/Rente

Tarifliche Jahressonderzahlung

30 Tage Urlaub

Job summary

Das Leibniz-Institut für Gartenbauwissenschaften (IGZ) in Großbeeren sucht eine Wissenschaftliche Mitarbeiterin im Bereich Mikrobielle Ökologie und Bioinformatik. Die Stelle ist befristet auf zwei Jahre mit Aussicht auf Verlängerung, teils in Teilzeit, und verbindet Laborarbeit mit Bioinformatik.

Hauptaufgaben umfassen molekulare Laborarbeiten, Sequenzierdatenanalyse und statistische Modellierung; zudem Feldprobenahme, Entwicklung von Reproducible-Workflows in R und Betreuung von Studierenden.

Qualifications

• Abgeschlossene Promotion in mikrobieller Ökologie, Bioinformatik oder verwandtem Fachgebiet.
• Erfahrung mit molekularbiologischen Techniken (DNA-/RNA-Extraktion, PCR).
• Fundierte Bioinformatik-Kenntnisse und Umgang mit Hochdurchsatz-Sequenzierdaten.
• Fortgeschrittene Programmierkenntnisse in R und reproducible Workflows.

Responsibilities

• Durchführung mikrobiologischer und molekularbiologischer Arbeiten an Umwelt- und Pflanzproben.
• Bioinformatische Verarbeitung und Qualitätskontrolle von Sequenzierdaten.
• Entwicklung statistischer Modelle zur Analyse von Mikrobiom- und Umwelt-Datensätzen.
• Durchführung von Feldprobenahmen und Erstellung von R-Skripten für Datenverarbeitung.
• Betreuung von Bachelor- und Masterstudierenden und Veröffentlichung von Ergebnissen.

Skills

Englischkenntnisse

Deutschkenntnisse

Teamfähigkeit

Education

Promotion in mikrobieller Ökologie oder Bioinformatik

Tools

R

dada2

QIIME

Job description

Das Leibniz-Institut für Gartenbauwissenschaften (IGZ) betreibt exzellente pflanzenwissenschaftliche Grundlagenforschung für die Anwendung im Gartenbau mit Schwerpunkt Gemüse und der Nutzung pflanzlicher Diversität. Das IGZ ist Teil der Leibniz-Gemeinschaft und hat seinen Sitz in Großbeeren. Weitere Informationen finden Sie auf unserer Webseite: www.igzev.de.

Im Institut ist ab dem 01.02.2027, befristet für zwei Jahre, in der Forschungsgruppe System Pflanze-Mikroorganismen folgende Stelle zu besetzen:

Wissenschaftlicher Mitarbeiterin (w,m,div.) im Bereich Mikrobielle Ökologie und Bioinformatik

Kennz. 17/2026/2

Die Vergütung erfolgt entsprechend der Qualifikation und Erfahrung nach dem Tarifvertrag TV L, bis zur Entgeltgruppe 13, Vollzeit. Die Stelle ist teilzeitgeeignet.

Die Forschungsgruppe System Pflanze-Mikroorganismen untersucht die Wechselwirkungen zwischen Pflanzen, ihren assoziierten Mikrobiomen und der Umwelt und verbindet dabei molekulare, bioinformatische und feldbasierte Ansätze, um mikrobiombasierte Strategien für eine nachhaltige, klimaresiliente Pflanzenproduktion zu identifizieren. Die Position verbindet praktische molekularbiologische Laborarbeit mit bioinformatischer Datenverarbeitung, fortgeschrittener statistischer Modellierung und feldbasierter Probenahme im Rahmen der Projekte der Gruppe.

Die Aufgaben umfassen

• Durchführung mikrobiologischer und molekularbiologischer Laborarbeiten an Umwelt- und pflanzenassoziierten Proben (z.B. Kultivierung, DNA-/RNA-Extraktion, PCR, Bibliotheksvorbereitung für Amplikon-/Metabarcoding-Sequenzierung)
• bioinformatische Prozessierung und Qualitätskontrolle von Sequenzierdaten (z.B. Amplikon-/Metabarcoding-Pipelines)
• Entwicklung und Anwendung fortgeschrittener statistischer Modelle zur Analyse von Mikrobiom-, ökologischen und experimentellen Datensätzen
• Durchführung grundlegender Feldprobenahmen (z.B. Boden-, Pflanzen- und Rhizosphärenproben) zur Unterstützung der Feldexperimente der Gruppe
• Erstellung von R-basierten Skripten und Workflows für Datenverarbeitung, statistische Analyse und Visualisierung
• Mitbetreuung von Bachelor- und Masterstudierenden
• Verfassen wissenschaftlicher Publikationen in internationalen Fachzeitschriften mit Peer-Review und Präsentation der Ergebnisse auf Konferenzen

Ihr Profil

• eine abgeschlossene Promotion in mikrobieller Ökologie, Bioinformatik oder einem verwandten naturwissenschaftlichem Fach
• praktische Erfahrung mit molekularbiologischen Labortechniken (Kultivierung, DNA-/RNA-Extraktion, PCR, Bibliotheksvorbereitung für die Sequenzierung)
• fundierte bioinformatische Kenntnisse, einschließlich Erfahrung in der Verarbeitung und Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzierdaten (z.B. Amplikon-/Metabarcoding-Pipelines wie dada2 oder QIIME)
• fortgeschrittene Programmierkenntnisse in R, einschließlich Datenaufbereitung, Visualisierung und reproduzierbarer Workflows
• fortgeschrittene Kompetenz in statistischer Modellierung und Analyse (z.B. gemischte Modelle, multivariate Statistik)
• Bereitschaft und Fähigkeit zur Durchführung grundlegender Feldarbeiten
• verhandlungssichere englische Sprachkenntnisse; Kenntnisse der deutschen Sprache sind von Vorteil
• eine offene, flexible und positive Person, die in einem Team arbeiten kann, aber auch in der Lage ist, die Initiative zu ergreifen
• Bereitschaft zu Dienstreisen, daher ist eine Fahrerlaubnis Klasse B (PKW) von Vorteil

Wir bieten

• einen attraktiven Arbeitsplatz an einem modernen Forschungsinstitut für Gartenbauwissenschaften
• ein engagiertes und kompetentes Team und eine anspruchsvolle Tätigkeit, die molekulare, bioinformatische, statistische und feldbasierte pflanzenwissenschaftliche Forschung miteinander verbindet
• flexible und familiengerechte Arbeitszeitmodelle und die Möglichkeit des mobilen Arbeitens (bis zu 50% der Arbeitszeit)
• VBL Ost-betriebliche Altersvorsorge im öffentlichen Dienst sowie tarifliche Jahressonderzahlung und 30 Tage