Bioinformatiker/ Omics Engineer (m/w/d)

Limbach Gruppe SE; Mainz; Vor Ort; EUR 40.000 - 60.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Ein innovatives Unternehmen sucht nach talentierten Fachkräften, die bereit sind, in einem dynamischen Umfeld zu arbeiten. In dieser Rolle haben Sie die Möglichkeit, Systeme für die Speicherung und Analyse großer NGS-Datenmengen zu entwickeln und zu optimieren. Sie werden Teil eines motivierten Teams, das an der Spitze der medizinischen Diagnostik steht. Hier können Sie Ihre Ideen einbringen und an einem modernen Arbeitsplatz mit flexiblen Arbeitsmodellen arbeiten. Wenn Sie eine Leidenschaft für Bioinformatik und Programmierung haben, ist dies die perfekte Gelegenheit für Sie, Ihre Karriere voranzutreiben und einen bedeutenden Beitrag zu leisten.

Leistungen

Flexibilität und Freiheit bei der Umsetzung von Ideen

Sicherer Arbeitsplatz mit langfristiger Perspektive

Herausfordernde Aufgaben in der medizinischen Diagnostik

Regelmäßige Fort- und Weiterbildungen

Moderne Geräteausstattung im Labor

Flexibles Arbeitsmodell mit Home-Office-Möglichkeiten

Qualifikationen

• Erfolgreicher Hochschulabschluss in Bioinformatik oder Informatik erforderlich.
• Erfahrung in der Dokumentation und Analyse von NGS-Daten ist vorteilhaft.

Aufgaben

• Aufbau und Betrieb von Systemen für NGS-Daten und biomedizinische Phänotypdaten.
• Optimierung von Workflows für die Analyse genomischer Varianten.

Kenntnisse

Python

Dokumentation

Bioinformatik

Git

TypeScript

R

SQL

Bash

Workflow Management

Ansible

Docker

Web-Anwendungen

Ausbildung

Bachelor in Bioinformatik/Informatik

Master in Bioinformatik/Informatik

Tools

Snakemake

Ansible

Docker

Jobbeschreibung

Uns ist bewusst, dass sich unsere ambitionierten Ziele nur mit einem exzellenten Team verwirklichen lassen, daher suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt in Vollzeit für unseren Standort Mainz:

Ihre Aufgaben

• Aufbau und Betrieb von Systemen für die Speicherung und den Transfer großer NGS-Datenmengen sowie biomedizinischer Phänotypdaten, auch über Standortgrenzen hinweg
• Aufbau, Wartung und Betrieb von Workflows für die Analyse von NGS-Daten mit dem Schwerpunkt genomischer Varianten
• Optimierung von programmatischen Arbeitsabläufen hinsichtlich Monitoring und Robustheit der eingesetzten Workflows

Ihr Profil

• Erfolgreicher Hochschulabschluss (Bachelor, Master, oder vergleichbar) in einem Fach wie Bioinformatik/ Informatik oder vergleichbare Qualifikation
• Sie arbeiten sehr strukturiert und haben Erfahrung mit der Dokumentation Ihrer Arbeit
• Erfahrung mit bioinformatischen Fragestellungen für die Auswertung humangenetischer Daten ist ein starkes Plus
• Sie haben sehr gute Programmierkenntnisse in Python und Erfahrung mit Git. Erfahrungen in TypeScript/R/SQL/Bash/etc. sind ein starkes Plus
• Erfahrung mit Workflow Management Systemen wie Snakemake ist ein starkes Plus
• Erfahrung mit "shared code ownership" und Code Reviews ist ein Plus
• Kenntnisse in der Verwendung von Konfigurationsmanagementsystemen wie Ansible und im Einsatz von Container-basierten Methoden wie Docker sind ein Plus
• Erfahrung in einem regulierten Bereich mit Qualitätsmanagementsystemen und relevanten DIN/ISO Normen ist ein Plus
• Erfahrung bei der Entwicklung moderner Web-Anwendungen ist ein Plus

Was wir bieten

• Große Flexibilität und Freiheit, eigene Ideen umzusetzen und ein modernes Arbeitsumfeld mitzugestalten
• Möglichkeit des Aufbaus und der Mitgestaltung des eigenen Aufgabenbereichs zur effizienten Ausgestaltung der vielfältigen Aufgabenbereiche
• Ein sicherer Arbeitsplatz mit langfristiger Perspektive und Wachstumspotenzial
• Herausfordernde und verantwortungsvolle Aufgaben in einem sich rasant entwickelnden und innovativen Bereich der medizinischen Diagnostik mit großem nationalen und internationalen Netzwerk
• Ein motiviertes und lösungsorientiertes Team, in dem Sie sich gemeinsam mit dem Unternehmen weiterentwickeln und wachsen können
• Regelmäßige Fort- und Weiterbildungen
• Laborneubau mit modernster Geräteausstattung
• Ein modernes, zeitgemäßes Arbeitsmodell mit Flexibilität und Offenheit für Home-Office-Arbeitsweisen

Wenn wir Ihr Interesse geweckt haben, freuen wir uns über Ihre vollständige Bewerbung unter Angabe Ihrer Gehaltsvorstellung und des frühestmöglichen Eintrittstermins.

Für eine erste Kontaktaufnahme steht Ihnen Frau Anita Dyrbusch, Tel. 06221 / 1853 - 249, gerne zur Verfügung.