NGS Scientist

Gi Life Sciences Basel; Basel; Vor Ort; CHF 90.000 - 130.000; Vollzeit

Zusammenfassung

Gi Life Sciences Basel sucht einen hochmotivierten NGS-Wissenschaftler/Associate Scientist zur Verstärkung eines Genomik-Platform-Teams in Basel. Fokus liegt auf Einzelzell-RNA-Sequenzierung, räumlicher Transkriptomik und Multi-Omics-Anwendungen, mit eigenständiger Durchführung von molekularbiologischen Experimenten.

Sie arbeiten interdisziplinär mit Bioinformatik- und Forschungs-Teams zusammen, entwickeln fortschrittliche NGS-Workflows und tragen zur Erzeugung hochwertiger, FAIR-konformer Daten

Qualifikationen

• Master-Abschluss in Molekularbiologie, Biotechnologie, Biochemie, Lebenswissenschaften, Genomik oder verwandtem Fachgebiet.

Aufgaben

• Entwicklung, Optimierung und Implementierung fortschrittlicher NGS-basierter Arbeitsabläufe (scRNA-seq, räumliche Transkriptomik, Multi-Omics).
• Durchführung molekularbiologischer Experimente und Fehlerbehebung.
• Probenverarbeitung, Nukleinsäureextraktion, PCR/qPCR, Bibliotheksvorbereitung, Sequenzierung und Qualitätskontrolle.
• Analyse und Dokumentation von Ergebnissen; Zusammenarbeit mit Bioinformatik-Teams.
• Sicherstellung hochwertiger, FAIR-konformer Daten; Präsentation von Ergebnissen gegenüber Stakeholdern.
• Beitrag zur Innovation und Weiterentwicklung der Plattformfähigkeiten.

Kenntnisse

NGS workflows

DNA/RNA extraction

PCR/qPCR

NGS library prep

Molekularbiologische Techniken

Umgang mit anspruchsvollen Proben

Englisch (Fließend)

Teamarbeit

Ausbildung

Master in Molekularbiologie oder verwandtem Fach

Master in Biotechnologie

Master in Genomik

Jobbeschreibung

Für unseren Kunden, ein führendes Pharmaunternehmen mit Sitz in Basel, suchen wir einen motivierten NGS-Wissenschaftler-

Einzelzell- und räumliche Omics-Technologien revolutionieren die biomedizinische Forschung, indem sie eine tiefgehende Charakterisierung komplexer biologischer Systeme mit beispielloser Auflösung ermöglichen. Diese Technologien liefern entscheidende Einblicke in zelluläre Heterogenität, Krankheitsmechanismen, therapeutische Reaktionen und translationale Biologie.

Wir suchen einen hochmotivierten Wissenschaftler / Associate Scientist zur Verstärkung eines hochmodernen Genomik-Plattform-Teams, das sich auf Einzelzell-Sequenzierung, räumliche Transkriptomik und Anwendungen der Next-Generation-Sequenzierung (NGS) konzentriert. Der erfolgreiche Kandidat wird an der Schnittstelle von Molekularbiologie, Genomik und translationaler Forschung arbeiten und die Entwicklung sowie Implementierung innovativer Omics-Technologien unterstützen, die wissenschaftliche Entdeckungen und therapeutische Innovationen beschleunigen.

Hauptverantwortlichkeiten

• Entwicklung, Optimierung und Implementierung fortschrittlicher NGS-basierter Arbeitsabläufe mit Fokus auf:
• Einzelzell-RNA-Sequenzierung (scRNA-seq)
• Räumliche Transkriptomik
• Multi-Omics- und multimodale Profilierungsansätze
• Eigenständige Durchführung molekularbiologischer Experimente und Fehlerbehebung bei komplexen Arbeitsabläufen.
• Durchführung von Probenverarbeitung, Nukleinsäureextraktion, PCR/qPCR, Bibliotheksvorbereitung, Sequenzierung und Qualitätskontrolle.
• Erzeugung, Analyse und Dokumentation experimenteller Ergebnisse mit hohem wissenschaftlichem Anspruch.
• Arbeit mit herausfordernden Probentypen, einschließlich FFPE-Gewebe, Primärproben und Proben mit geringem Input.
• Enge Zusammenarbeit mit Bioinformatik- und funktionsübergreifenden Forschungsteams zur Interpretation von Sequenzierungsdatensätzen und Gewinnung biologischer Erkenntnisse.
• Sicherstellung der Erzeugung hochwertiger, FAIR-konformer Daten.
• Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse, Protokolle und Empfehlungen gegenüber internen Stakeholdern.
• Beitrag zur kontinuierlichen Innovation und Verbesserung der Plattformfähigkeiten.

Erforderliche Qualifikationen

• Master-Abschluss in Molekularbiologie, Biotechnologie, Biochemie, Lebenswissenschaften, Genomik oder einem verwandten Fachgebiet.
• 1-3 Jahre Industrie- oder relevante Forschungserfahrung in Genomik oder Molekularbiologie.
• Praktische Erfahrung mit Next-Generation-Sequencing (NGS)-Arbeitsabläufen.
• Fundierte Kenntnisse in:
• DNA/RNA-Extraktion
• PCR und qPCR
• NGS-Bibliotheksvorbereitung
• Molekularbiologischen Labortechniken
• Erfahrung im Umgang mit klinischen oder herausfordernden biologischen Proben wie FFPE-Gewebe, Tumorproben oder Proben mit geringem Input.
• Nachgewiesene Fähigkeit, Experimente eigenständig zu entwerfen, durchzuführen, zu analysieren und Fehler zu beheben.
• Starke Kommunikationsfähigkeiten und Fähigkeit zur effektiven Zusammenarbeit in multidisziplinären Teams.
• Fließendes Englisch.

Bevorzugte Qualifikationen

• Praktische Erfahrung mit Einzelzell-Sequenzierungsplattformen (z. B. 10x Genomics Chromium).
• Erfahrung mit räumlicher Transkriptomik und räumlichen Biologietechnologien (z. B. Visium, Xenium, CosMx, RNAscope).
• Kenntnisse in Transkriptomik, Genomik und Multi-Omics-Ansätzen.
• Erfahrung in Assay-Entwicklung, Methodenoptimierung und Technologieimplementierung.
• Vertrautheit mit grundlegenden bioinformatischen Analysen und Interpretation von Sequenzierungsdatensätzen.
• Erfahrung in einem pharmazeutischen, biotechnologischen oder translationalen Forschungsumfeld.

Was wir suchen

Wir sind besonders an Kandidaten interessiert, die fundierte Genomik-Expertise im Nasslabor mit einer Leidenschaft für aufkommende Technologien wie Einzelzell-Sequenzierung und räumliche Biologie verbinden. Erfolgreiche Kandidaten sind neugierig, innovativ, kooperativ und begeistert davon, modernste Omics-Technologien anzuwenden, um translationale Forschung und therapeutische Entdeckungen voranzutreiben.