Senior Bioinformatiker – Klinisk Genomik & NGS

Karolinska University Hospital; Stockholms kommun; Sur place; SEK 550 000 - 750 000; Plein temps

Résumé du poste

Karolinska Universitetssjukhuset söker bioinformatiker till Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK). Du kommer att arbeta i ett multidisciplinärt team tillsammans med läkare, molekylärbiologer och mjukvaruutvecklare för storskaliga genomikanalyser.

Vi söker en analytisk och noggrann kandidat med erfarenhet av NGS och starka kunskaper i Python/R samt Linux och HPC-miljöer. Engagemang för kvalitet och klinisk relevans är viktigt.

Qualifications

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik eller annat relevant område.
• Dokumenterad erfarenhet av bioinformatorisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
• Goda programmeringskunskaper (t.ex. Python, R)
• Vana att arbeta i Linuxmiljö
• Erfarenhet av arbete i HPC-miljö, gärna med SLURM
• Goda kunskaper inom statistik, analys och testdesign
• Mycket god förmåga att uttrycka dig på engelska, både muntligt och skriftligt

Responsabilités

• Bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av bioinformatiska NGS-flöden.
• Analysera patientprover inom interna och externa forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt.
• Bidra med expertis inom dataanalys i bioinformatiska utvecklingsprojekt.
• Delta i teamets dagliga arbete och bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.
• Delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten inom Genomic Medicine Sweden (GMS).

Connaissances

Python

R

Linux

HPC SLURM

Engelska

Formation

Magisterexamen inom bioinformatik

Outils

Docker

Singularity

Description du poste

Karolinska Universitetssjukhuset söker bioinformatiker till Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK). Du kommer att arbeta i ett multidisciplinärt team tillsammans med läkare, molekylärbiologer och mjukvaruutvecklare för storskaliga genomikanalyser.

Vi söker en analytisk och noggrann kandidat med erfarenhet av NGS och starka kunskaper i Python/R samt Linux och HPC-miljöer. Engagemang för kvalitet och klinisk relevans är viktigt.