Forskningsingenjör

Uppsala Universitet; Uppsala kommun; On-site; SEK 320,000 - 420,000; Full time

Job summary

Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, söker en medarbetare till Uppsala Genome Center som deltar i laboratoriearbete med olika DNA/RNA- long-read sekvenseringsmetoder (PacBio, Oxford Nanopore). Arbetet innefattar provberedning, ankomstkontroll och felsökning av instrument.

Du kommer även att hantera datoruppgifter, utveckla funktioner i Microsoft Excel för dokumentation av provflöden och dataöversikter samt arbeta med MiniLims.

Qualifications

• Högskoleutbildning inom biologi eller molekylärbiologi eller motsvarande.
• Erfarenhet av provberedning och instrument för DNA/RNA-sekvensbestämning med NGS-teknologier.
• Goda kunskaper i Microsoft Office och erfarenhet av UNIX-baserade program.

Responsibilities

• Delta i laborativt arbete med DNA/RNA-long-read sekvensering (PacBio och ONT).
• Utföra ankomstkontroll och provberedning för sekvensanalys, manuellt eller automatiserat.
• Underhålla och felsöka instrument; hantera datoruppgifter och registrering i MiniLims.

Skills

MS Office

UNIX-baserade program

Kommunikation svenska/engelska

Education

Biologi / Molekylärbiologi utbildning

Tools

MiniLims (BioTeam)

NGS-instrument (PacBio, ONT)

Job description

Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi

Arbetsuppgifter
Vi söker en medarbetare till Uppsala Genome Center som ska delta i det laborativa arbetet med olika DNA/RNA-”long-read”-sekvenseringsmetoder. Detta innefattar s.k. Next Generation DNA-sekvensering (NGS) med teknologier från PacBio (Revio) och Oxford Nanopore Technologies (PromethION, MinION och Flongle). Arbetet innefattar ankomstkontroll och provberedning av DNA- och RNAprover för sekvensanalys. Provberedning sker i huvudsak manuellt men i vissa fall automatiserat med datorstyrda pipetteringsrobotar. Arbetet innefattar också hantering, underhåll och vid behov felsökning av de instrument som används i verksamheten. Vissa datorrelaterade uppgifter ingår i arbetet, såsom användning av MiniLims (BioTeam) för registrering av projekt, prover och arbetsflöden. Utveckling av funktioner i Microsoft Excel för att underlätta dokumentation av provflöde, provhantering och sammanställningar av data. Analys och bearbetning av NGS-data kommer ev. också att ingå i arbetsuppgifterna.

Kvalifikationskrav
Högskoleutbildning inom biologi, molekylärbiologi, bioteknik eller motsvarande. Erfarenhet av arbete med provberedning och instrument för DNA/RNA-sekvensbestämning med hjälp av NGS-teknologier. Goda kunskaper i användning av Microsoft Office och erfarenhet av UNIX-baserade program. Arbetet innebär att kontinuerligt lära sig hantera nya instrument samt nya metoder och protokoll för provberedning. Ett krav är förmåga att med eget initiativ och självständighet utföra arbetet enligt uppdrag samt att ta ansvar för utfört arbete gentemot uppdragsgivare. Den sökanden ska ha dokumenterad erfarenhet av självständigt arbete. God förmåga att kommunicera på svenska och engelska i tal och skrift är ett krav då återkommande kontakt och kommunikation med de forskare som vi utför uppdrag åt är en viktig del av verksamheten.

Meriterande
Vi söker en medarbetare som är utåtriktad, resultatorienterad, har god samarbetsförmåga och som trivs att arbeta i grupp. Sökande behöver ha god arbetsdiciplin och noggrannhet. Vi ser gärna sökande med erfarenhet från arbete i liknande form av uppdragsverksamhet. Erfarenhet av arbete inom ackrediterad verksamhet är meriterande. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet. Arbetet kan periodvis medföra hög arbetsbelastning.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, 2 år. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av:Susanne Hellstedt Kerje, [e-mail]

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Fackliga företrädare: Saco-S - [e-mail], Seko - [e-mail], ST (OFR/S) - [e-mail]

Anställningsform Tidsbegränsad anställning

Löneform Individuell lönesättning