Postdoctoral position in epigenomic data analysis

Uppsala Universitet; Uppsala kommun; On-site; SEK 603,000 - 781,000; Full time

Job summary

Uppsala universitet söker en forskare som vill arbeta med epigenomiska dataset i toxikologi och miljöhälsa inom EpiTox-gruppen vid Institutionen för organismbiologi. Anställningen är kopplad till EU-projekten RE-MEND och ExpoSignalz och fokuserar på att avslöja epigenetiska markörer för exponeringsinducerade effekter på hjärnan.

Du genomför bioinformatiska och biostatistiska analyser av Oxford Nanopore-sekvenserade data från mus- och zebrafiskmodeller, samt multi-omics integration.

Qualifications

• Doktorsexamen inom bioinformatik/beräkningsbiologi eller likvärdigt.
• Kunskap i R och/eller Python samt analys av DNA-metyleringsdata.
• Engelska i tal och skrift krävs i internationell miljö.
• Meriterande: multi-omics integration.

Responsibilities

• Genomföra bioinformatiska och biostatistiska analyser av epigenomiska dataset.
• Skriva vetenskapliga publikationer, bidra till projekt- och rapportskrivning samt presentera resultat vid möten och konferenser.
• Ge stöd och vägledning till doktorand- och masterstudenter samt delta i institutionens vetenskapliga och sociala aktiviteter.
• Planera, genomföra, analysera och tolka eget arbete självständigt.

Skills

R

Python

Epigenomics

Biostatistics

Education

Doktorsexamen i bioinformatik / beräkningsbiologi

Tools

Oxford Nanopore

Job description

Uppsala universitet, Institutionen för organismbiologi

Är du intresserad av att arbeta med epigenomiska dataset i samband med kemiska risker och människors hälsa i en trevlig, dynamisk och internationell miljö? Sök postdoc-tjänsten inom epigenetisk dataanalys i Molekylär toxikologi och epigenetik- ( EpiTox- ) gruppen vid Institutionen för organismbiologi, som arbetar med epigenomisk och annan molekylär kartläggning för att avslöja mekanismer bakom (hjärn)utvecklingseffekter av hormonstörande kemikalier (EDC). EpiTox-gruppen är en del av forskningsprogrammet Fysiologi och miljötoxikologi , en växande och inspirerande forskningsmiljö där experimentella modeller och molekylära verktyg används för att studera och förstå cellulära och molekylära mekanismer hos djur och växter som ligger till grund för hela organismers fysiologi, utveckling och miljörespons. Du kommer att arbeta inom de EU-finansierade projekten RE-MEND och ExpoSignalz. Dessa är tvärvetenskapliga projekt med flera samarbetspartners och fokus på psykisk hälsa respektive neurodegeneration. I båda projekten är EpiTox-gruppens roll att identifiera epigenetiska markörer för exponeringsinducerade effekter på hjärnan med hjälp av olika experimentella modeller. Arbetsuppgifter

Du kommer att genomföra bioinformatiska och biostatistiska analyser av olika epigenomiska dataset som genereras med Oxford Nanopore-sekvensering (DNA-modifikationer) från mus- och zebrafiskmodeller. Multi-Omics integration kommer också vara en del av arbetet. Arbetet omfattar även att skriva vetenskapliga publikationer, bidra till projektrapporter samt presentera resultat vid projektmöten och internationella konferenser. Du förväntas självständigt planera, genomföra, analysera och tolka ditt arbete. Du kommer också att ge stöd och vägledning till doktorand- och masterstudenter samt aktivt delta i gruppens, programmets och institutionens vetenskapliga och sociala verksamhet. Kvalifikationskrav

Doktorsexamen eller en utländsk examen som motsvarar en doktorsexamen inom bioinformatik, beräkningsbiologi eller områden som arbetsgivaren bedömer som likvärdiga. Examen måste vara avlagd vid tidpunkten för anställningsbeslutet. De som har avlagt doktorsexamen högst tre år före ansökningstidens utgång prioriteras för anställningen. Utgångspunkten för treårsperioden är ansökningstidens slutdatum. På grund av särskilda omständigheter kan examen ha avlagts tidigare. Treårsperioden kan förlängas vid omständigheter som sjukledighet, föräldraledighet, fackliga uppdrag etc.

Väl dokumenterad erfarenhet av arbete med R eller Python, analys av DNA-metyleringsdataset samt kunskap om statistiska analyser av sådana data och om miljöepigenomik är ett krav. Eftersom arbetet kommer att utföras i en internationell och tvärvetenskaplig miljö krävs utmärkta muntliga och skriftliga kommunikationskunskaper i engelska. Önskvärt/meriterande i övrigt

Eftersom det kan finnas behov av att förbereda nya sekvenseringsbibliotek är erfarenhet av molekylärbiologiska laboratorietekniker, särskilt Oxford Nanopore-bibliotekspreparationer, mycket värdefullt. Det är också en stor fördel att ha erfarenhet av integrering av multiomikdata (multi-omics integration).

Stor vikt kommer också att läggas vid personliga egenskaper. Vi söker en mycket motiverad person med originellt, kreativt och analytiskt tänkande samt god samarbetsförmåga. Sökanden förväntas ta initiativ och arbeta självständigt. Om anställningen

Anställningen är tidsbegränsad i 2 år med möjlighet till förlängning på ytterligare 1 år. Omfattningen är 100 %. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Institutionen för Organismbiologi, Evolutionsbiologiskt centrum vid Uppsala universitet

Upplysningar om anställningen lämnas av: Joëlle Rüegg, [e-mail] Välkommen med din ansökan senast den 30 november 2026, UFV-PA 2026/3280 .

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Fackliga företrädare: Saco-S - [e-mail], Seko - [e-mail], ST (OFR/S) - [e-mail]

Anställningsform Tidsbegränsad anställning