Doktorand i evolutionär och ekologisk genetik

Uppsala universitet (Uppsala University); Uppsala kommun; On-site; SEK 357,000 - 469,000; Full time

Job summary

Uppsala universitet söker en doktorand till Institutionen för ekologi och genetik (IEG) vid Evolutionsbiologiskt centrum. Du kommer att arbeta med populationsgenetik, kvantitativ genetik och data från ett stort Evolve-and-Resequence‑experiment på Callosobruchus maculatus.

Projektet kombinerar laboratoriearbete och bioinformatorisk analys, med möjligheter till undervisning och nätverkande inom universitetet och SciLifeLab. Anställningen är tidsbegränsad till fyra år och placering sker i Uppsala.

Qualifications

• Magisterexamen (andra cykeln) i evolutionsbiologi, ekologi, bioinformatik eller ett relaterat område
• Alternativt motsvarande kunskaper genom omfattande forskningserfarenhet
• Kandidatexamen eller likvärdiga meriter accepteras om krav uppfylls vid anställningstillfälle

Responsibilities

• Doktorandprojektet innebär kombinerat laboratoriearbete och bioinformatorisk analys, huvuddelen av arbetet sker i dataanalys
• Undervisning samt utveckling av pedagogiskt CV genom kurser, upp till högst 20 % av heltid
• Samarbete med huvudhandledare och SciLifeLab-forskaren vid IEG

Skills

Programmering

Engelska

Education

Masterexamen i evolutionsbiologi

Job description

2026-09-09

Vill du bedriva banbrytande forskning i en framstående miljö inom evolutionsbiologi vid Sveriges största fakultet för naturvetenskap och teknik? Institutionen för ekologi och genetik vid Uppsala universitet bedriver världsledande forskning inom biologi, från molekyler till ekosystem och globala biodiversitetsmönster. Vi söker nu en doktorand som vill utveckla sin forskarkarriär tillsammans med oss.

Institutionen för ekologi och genetik (IEG) vid Evolutionsbiologiskt centrum (EBC) är en internationell miljö där våra medarbetare bedriver forskning för att förstå ekologiska och evolutionära processer på alla nivåer av biologisk organisation. IEG erbjuder tillgång till avancerade nationella och lokala forskningsinfrastrukturer, inklusive superdatorresurser (NAISS) och de senaste molekylära teknologierna och sekvenseringsplattformarna (SciLifeLab-plattformar). IEG har ett klimatlaboratorium med kontrollerade miljökammare och växthus, ett toppmodernt molekylärt laboratorium, samt anläggningar för djuruppfödning. Doktorander vid IEG kan ansluta sig till forskarskolan, som erbjuder goda möjligheter till nätverkande både på och utanför campus med doktorander från de två andra biologiska institutionerna vid Uppsala universitet (Institutionen för organismbiologi och Institutionen för cell- och molekylärbiologi).

Tjänsten erbjuds inom forskningsprogrammet för Zooekologi vid IEG. Programmets nuvarande forskning omfattar populations- och bevarande-genomik och kvantitativ genetik, evolutionär ekologi, beteendeekologi, och makroekologi. Ytterligare information om programmet för djurekologi finns här.

Projektbeskrivning

En central fråga inom evolutionsbiologi är om evolutionära förändringar är upprepbara och om samma gener bidrar till upprepade fenotypiska anpassningar. Denna fråga har viktiga implikationer för vår förmåga att kunna förutsäga genetiska responser på förändrade miljöer. Detta projekt ämnar integrera mekanistiska insikter om fenotypisk anpassning med genomiska data för att förstå hur arter utvecklar anpassningar till förändringar i sin livsmiljö.

Projektet kommer att utnyttja data från ett storskaligt Evolve-and-Resequence-experiment på en utbredd skadeinsekt, fröbaggen Callosobruchus maculatus. Detta unika system möjliggör studier av determinismens och slumpens roll för lokal anpassning och evolutionen av en arts ekologiska nisch. Fenotypiska data, RNA‑seq och DNA pool‑seq-data finns tillgängliga från flera tidpunkter i experimentet, som fortfarande pågår. Berger‑gruppen upprätthåller även flera andra geografiska populationer av C. maculatus samt närbesläktade arter av fröbaggar. Detta ger möjligheter till komparativ genomik samt ytterligare experiment och datainsamling.

Arbetsuppgifter

Doktorandprojektet kommer att innefatta en kombination av experimentellt laboratoriearbete samt bioinformatisk analys, med tyngdpunkt på det senare. Den exakta fördelningen mellan arbetsuppgifterna kan bero på kandidatens intressen och projektets utveckling.

Doktorander vid Institutionen för ekologi och genetik (IEG) har möjlighet att delta i undervisning och att utveckla sitt pedagogiska CV genom att gå kurser. Typ och omfattning av undervisningen beror på tillgång och studentens intressen men får inte överstiga 20 % av heltid. Anställning och finansiering förlängs motsvarande den tid som läggs på undervisning.

Doktoranden kommer att arbeta tillsammans med huvudhandledaren David Berger och biträdande handledaren, SciLifeLab-forskaren Dr Gabriela Montejo‑Kovacevich, båda verksamma vid IEG.

Kvalifikationskrav

• ha en magisterexamen (andra cykeln) i evolutionsbiologi, ekologi, bioinformatik eller ett relaterat område, eller
• ha avslutat minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 poäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt projekt värt minst 15 poäng, eller
• ha förvärvat motsvarande kunskaper på annat sätt (t.ex. omfattande forskningserfarenhet).

Kandidater som ej ännu tagit ut sin examen men förväntas uppfylla kraven vid tillträdesdatum kan söka tjänsten.

Den Ideala Kandidaten Bör Även

• Ha god förståelse för centrala begrepp inom ekologi och/eller evolutionsbiologi/genetik.
• Ha erfarenhet av programmering.
• Vara motiverad och nyfiken samt trivas i en samarbetsinriktad miljö.
• Kunna ta ansvar för att genomföra och slutföra självständiga uppgifter och projekt.
• Kunna uttrycka sig väl i både talad och skriven engelska.

Meriterande

Erfarenhet av statistiska analyser tillämpade på kvantitativ genetisk eller populationsgenomisk data. Erfarenhet av arbete med bioinformatiska pipelines på servrar och kluster. Experimentellt arbete, såsom erfarenhet av experimentell evolution eller arbete med genetiska linjer.

Om anställningen

Anställningen är en tidsbegränsad tjänst enligt högskoleförordningen kapitel 5.

• 7. Omfattning: heltid (100 %), i fyra år. Tillträdesdatum: 2027; flexibelt enligt överenskommelse. Placering: Uppsala Universitet.

Regler för doktorander framgår av högskoleförordningen kapitel 5,

• 1–7 samt av Uppsala universitetets regler och riktlinjer.

Universitetslektor, David Berger, [e-mail]

Upplysningar om anställningen lämnas av

Universitetets lektor, David Berger, [e-mail]

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Fackliga företrädare:

Saco-S - [e-mail], Seko - [e-mail], ST (OFR/S) - [e-mail]

Placering

Institutionen för ekologi och genetik

Omfattning: Heltid

Sysselsättningsgrad: 100 %

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning

Lön: Lönesättning sker i enlighet med fastställd lönetrappa för doktorandbefattningar

Antal lediga befattningar: 1

Ort: Uppsala

Facklig företrädare: