Postdoctoral position in structure-based drug design using machine learning

Uppsala Universitet; Uppsala kommun; On-site; SEK 480,000 - 560,000; Full time

Job summary

Uppsala universitet söker en postdoktor inom strukturbaserad läkemedelsdesign med maskininlärning till Institutionen för cell- och molekylärbiologi i Uppsala. Anställningen är tidsbegränsad i två år och heltid, med placering i Uppsala.

Fokus ligger på att utveckla och tillämpa modelleringsmetoder för receptor-ligand-interaktioner, särskilt G-proteinkopplade receptorer, i nära samarbete med experimentella forskare. Ansök senast 23 november 2026.

Qualifications

• Doktorsexamen i beräkningskemi eller motsvarande examen uppfyllt senast beslut.
• Avlagd examen högst tre år sedan ansökningsdagen.
• Engelska krävs i skrift och tal i en internationell miljö.

Responsibilities

• Utveckla strukturbaserade screeningmetoder för att identifiera ligander till peptidbindande receptorer.
• Använda molekylär docking och maskininlärning för att söka i kemiska bibliotek.
• Samarbeta tvärvetenskapligt med experimentella forskargrupper inom Biodiversity2Drugs-projektet.

Skills

Beräkningskemi

Molekylär dockning

Co-folding-metoder

Engelska (vetenskapligt)

Education

Doktorsexamen i beräkningskemi

Job description

Postdoktor inom strukturbaserad läkemedelsdesign med maskininlärning

Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi

Är du intresserad av att utveckla metoder för att upptäcka nya läkemedel med hjälp av datorsimuleringar? Vi välkomnar din ansökan till en postdoktortjänst i den internationella och vetenskapligt framstående forskningsmiljön vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Uppsala universitet.

Institutionen för cell- och molekylärbiologi ( https://icm.uu.se ) är organiserad i sju forskningsprogram med inriktning på beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi.

Tjänsten är placerad i forskargruppen som leds av professor Jens Carlsson och som ingår i forskningsprogrammet för beräkningsbiologi och bioinformatik. Carlssons forskargrupp utvecklar och tillämpar modelleringsmetoder för att studera molekylära interaktioner mellan proteiner och ligander, särskilt hur receptorer och enzymer binder läkemedel. G-proteinkopplade receptorer är ett centralt forskningsområde för gruppen eftersom de spelar viktiga roller i fysiologiska processer. Forskargruppen använder strukturbaserade modeller för att förstå de molekylära mekanismerna bakom receptorsignalering och för att designa ligander till dessa farmakologiskt viktiga målproteiner, ofta i nära samarbete med experimentella forskare. Carlssons forskargrupp är internationell och också en del av Science for Life Laboratory ( http://www.scilifelab.se /). Besök forskargruppens webbplats ( www.carlssonlab.org ) för mer information.

Projektets huvudsakliga mål är att utveckla och tillämpa strukturbaserade screeningmetoder för att identifiera ligander till peptidbindande receptorer i stora kemiska bibliotek. Inom projektet kommer molekylär dockning och maskininlärningsmetoder att användas för att söka efter ligander i kombinatoriska bibliotek av peptider och peptidomimetika, samt i samlingar av naturligt förekommande peptider från mikroorganismer, växter och djur. Arbetet omfattar också samarbeten med experimentella forskargrupper inom projektet Biodiversity2Drugs ( https://www.biodiversa.eu/2025/04/08/biodiversity2drugs /), som fokuserar på att identifiera bioaktiva peptider som påverkar receptorer med terapeutisk relevans.

Kvalifikationskrav

Doktorsexamen i beräkningskemi eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i beräkningskemi. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.

Kompetens inom beräkningskemi, med dokumenterad erfarenhet av kemoinformatik och strukturbaserad liganddesign, är ett krav. Goda kunskaper i molekylär dockning eller co‑folding‑metoder för att förutsäga protein–ligandkomplex samt erfarenhet av att arbeta med kemiska bibliotek är ett krav. Goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska är ett krav eftersom arbetet sker i en internationell miljö. Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom god samarbetsförmåga, kreativitet, motivation och självständighet.

Önskvärt/meriterande i övrigt

Erfarenhet av maskininlärning, programmering och strukturbaserad modellering av receptorer och peptider är meriterande men inget krav.

Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad i två år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 2027-01-01ellerenligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningarom anställningen lämnas av:Jens Carlsson, [e-mail], Tel: [phone].

I denna rekrytering har vi ersätt den personliga brevet med frågor som du besvarar i samband med din ansökan. Svaren kommer att användas som en del i urvalsprocessen. Välkommen med din ansökan senast den 23 November 2026, UFV-PA 2026/3253.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Fackliga företrädare: Saco-S - [e-mail], Seko - [e-mail], ST (OFR/S) - [e-mail]