Bioinformatikingenjör – precisionsmedicin & cancerforskning

Umeå University; Umeå kommun; On-site; SEK 420,000 - 560,000; Full time

Job summary

Umeå universitet söker en forskningsingenjör till Clinical Genomics Umeå för att applicera bioinformatiska färdigheter på prekliniska och kliniska forskningsfrågor. Du arbetar i nära samarbete med kliniska och forskande enheter och bidrar till utveckling av nya metoder inom precisionsmedicin.

Du kommer att analysera storskaliga sekvensdata samt utveckla och kvalitetssäkra bioinformatiska flöden och verktyg, främst inom cancer och ärftliga sjukdomar, i laboratoriemiljö på Umeå universitet.

Qualifications

• Examen på grund- eller avancerad nivå inom bioinformatik, bioteknik eller annan motsvarande utbildning relevant för anställningen.
• Dokumenterad erfarenhet av analys av storskaliga dataset, inklusive NGS-data.
• Goda programmeringskunskaper i Python och erfarenhet av Linuxmiljö.
• Vana att använda versionshanteringssystem, t.ex. Git.
• Erfarenhet av analyshanteringsverktyg som Snakemake och Nextflow och arbetsbelastningshanterare som Slurm.

Responsibilities

• Skapa, utveckla och kvalitetssäkra bioinformatiska flöden.
• Utveckla bioinformatiska verktyg och analysera olika typer av rådata.
• Arbeta i forsknings- och utvecklingsprojket med fokus på cancer och ärftliga sjukdomar.

Skills

Python

Linux

Git

Snakemake

Nextflow

Slurm

Bioinformatics

Education

Bachelor's/Master's in bioinformatics/biotechnology

Tools

Docker

Apptainer

R

Rust

Go

Job description

Umeå universitet söker en forskningsingenjör till Clinical Genomics Umeå för att applicera bioinformatiska färdigheter på prekliniska och kliniska forskningsfrågor. Du arbetar i nära samarbete med kliniska och forskande enheter och bidrar till utveckling av nya metoder inom precisionsmedicin.

Du kommer att analysera storskaliga sekvensdata samt utveckla och kvalitetssäkra bioinformatiska flöden och verktyg, främst inom cancer och ärftliga sjukdomar, i laboratoriemiljö på Umeå universitet.