Bioinformatiker inom cancergenomik till GMCK

Karolinska University Hospital; Solna kommun; Híbrido; SEK 700 000 - 1 000 000; Tempo integral

Vantagens oferecidas por esta oferta de emprego

Hybridarbete

Fortbildningstöd

Inkluderande miljö

Resumo da oferta

Karolinska Universitetssjukhuset söker en bioinformatiker inom cancergenomik till GMCK för tolkning av storskaliga DNA/RNA-sekvenseringar. Du sammanställer underlag och säkerställer kvalitet innan medicinsk bedömning av patolog. Rollen innebär möjligheter att ta större ansvar över tid och bidra till utvecklingen av tolkningsflöden.

Du arbetar i ett tvärvetenskapligt team med flexibla arbetstider och hybridarbete.

Qualificações

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område.
• Dokumenterad erfarenhet av bioinformativ dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
• Erfarenhet av arbete eller forskning inom cancergenomik och/eller cancerbiologi.
• Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, i både tal och skrift (svenska krävs för den dagliga kommunikationen med övrig vårdpersonal).
• Meriterande: Doctorsexamen inom relevant område; erfarenhet av varianttolkning / annotering av somatiska varianter; erfarenhet av klinisk sjukhusmiljö.

Responsabilidades

• tolka genetiska varianter (SNV, CNV, fusioner m.fl.).
• samarbeta nära och diskutera resultat med patologer, molekylärbiologer och kliniker.
• bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av tolkningsflödena.
• delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.
• delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten inom Genomic Medicine Sweden (GMS).

Conhecimentos

Bioinformatik

NGS-analys

Samarbete

Formação académica

Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik

Dokumenterad erfarenhet av bioinformativ dataanalys

Erfarenhet av cancergenomik

Språk: svenska och engelska

Ferramentas

Python

Linux/HPC

Descrição da oferta de emprego

Bioinformatiker inom cancergenomik till GMCK

Vill du arbeta i absolut framkant av den molekylära precisionsdiagnostiken? Vi söker en bioinformatiker till vårt tolkningsteam inom cancerområdet. Här får du en nyckelroll där din analys och tolkning direkt påverkar diagnostik och behandlingsbeslut för cancerpatienter.

• Ett meningsfullt arbete där din insats gör direkt nytta i patientdiagnostiken.
• En roll med goda utvecklingsmöjligheter och att över tid ta ett större ansvar.
• Möjlighet att arbeta i ett tvärvetenskapligt team med flexibla arbetstider och hybridarbete.
• Stöd för fortbildning och professionell utveckling i en inkluderande miljö på ett av världens främsta universitetssjukhus.

Tjänsten är placerad vid Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), som är en del av Medicinsk diagnostik Karolinska (MDK). GMCK ansvarar för att tillhandahålla storskaliga och avancerade genomikanalyser till samtliga laboratoriemedicinska specialiteter inom MDK. Vårt uppdrag är att möjliggöra precisionsdiagnostik genom högkvalitativa genetiska analyser med fokus på klinisk relevans och teknisk spetskompetens.

I den här rollen blir du en del av vårt tolkningsteam inom solida tumörer. Huvudfokus ligger på att tolka bioinformatiska resultat från storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS) utifrån etablerade standardrutiner (SOP:er). Du sammanställer och kvalitetssäkrar underlagen som sedan lämnas över till patolog för slutgiltig medicinsk bedömning.

För rätt person finns det goda möjligheter att på sikt få ett utökat ansvar, samt bidra till vidareutvecklingen av våra tolkningsflöden och rutiner.

I rollen kommer du bland annat att:

• tolka genetiska varianter (SNV, CNV, fusioner m.fl.).
• samarbeta nära och diskutera resultat med patologer, molekylärbiologer och kliniker.
• bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av tolkningsflödena.
• delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.
• delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS).

Vi söker dig som

• är noggrann, strukturerad och har hög ansvarskänsla för kliniska leveranser.
• har en god kommunikativ förmåga och trivs i gränssnittet mellan bioinformatik och medicinsk diagnostik.
• har ett engagemang för kvalitet och trivs med att samverka i grupp.

Kvalifikationer

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område.
• Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
• Erfarenhet av arbete eller forskning inom cancergenomik och/eller cancerbiologi.
• Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, i både tal och skrift (svenska krävs för den dagliga kommunikationen med övrig vårdpersonal).

Meriterande:

• Doktorsexamen (PhD) inom relevant område.
• Praktisk erfarenhet av varianttolkning och/eller annotering av somatiska varianter inom cancergenomik.
• Erfarenhet av arbete som sjukhusgenetiker eller biträdande sjukhusgenetiker (eller motsvarande klinisk roll).
• Erfarenhet av arbete i klinisk sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189).
• Erfarenhet av, eller intresse för operativ samordning eller projektledning.
• Kunskap om klassificeringssystem för somatiska varianter (t.ex. AMP-riktlinjer).
• God programmeringsförmåga (t.ex. Python) och vana av Linux-miljöer/HPC.

Urval och intervjuer kan komma att ske löpande under ansökningstiden.

Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!

Inför tillsättning av befattning som innefattar vård av barn och ungdom, kontrolleras den som erbjuds tjänsten mot misstanke- och belastningsregistret. Här kan du läsa mer om rekryteringsprocessen och om vilka kontroller som utförs på Karolinska.

Som anställd på Karolinska Universitetssjukhuset kan du komma att krigsplaceras. Läs mer om vad det innebär här.

Om du är eller tidigare har varit anställd i Region Stockholm kommer vi att ta interna referenser från din nuvarande eller tidigare chef om du blir aktuell för anställning.

För tillsvidaretjänster kan provanställning komma att tillämpas.

Om Karolinska Universitetssjukhuset Vi på Karolinska Universitetssjukhuset är stolta över att vi är ett av världens främsta universitetssjukhus. Förutom vårt särskilda ansvar för den högspecialiserade vården i Stockholmsregionen är huvuduppdraget att tillsammans med Karolinska Institutet utbilda framtidens vårdanställda och bedriva världsledande forskning samtidigt som vi fortsätter vårt arbete med att utveckla vården för patientens bästa. Vi arbetar inom en rad olika områden och professioner.

Du kan läsa mer om vårt uppdrag inom vård, forskning och utbildning här.

Vår vision - Vi ska bota och lindra imorgon det ingen kan bota och lindra idag.

Läs gärna mer om oss på karolinska.se och följ oss på sociala medier!

Funktion Medicinsk Diagnostik Karolinska

Funktion Medicinsk Diagnostik Karolinska är en sammanslagning av Karolinska Universitetslaboratoriet och Bild och Funktion med laboratorieverksamhet, radiologi, nuklearmedicin, medicinsk strålningsfysik, radiofarmaci och strålsäkerhet inom Karolinska Universitetssjukhuset.

Här kan du läsa mer om Medicinsk Diagnostik Karolinska.

Här kan du läsa mer om Karolinska Universitetslaboratoriet.

Vi eftersträvar jämställdhet och jämlikhet på vår arbetsplats och ser gärna sökande med olika bakgrund och förutsättningar.

Region Stockholm ansvarar för hälso- och sjukvård, kollektivtrafik, regional utveckling och bidrar till kulturlivet. Varje dag, dygnet runt. I landets snabbaste växande region. Tillsammans skapar vi Europas attraktivaste storstadsregion.