Bioinformatiker inom cancergenomik till GMCK

Karolinska University Hospital; Stockholms kommun; Hybrid; SEK 900,000 - 1,100,000; Full time

Benefits offered by this job

Fortbildning

Hybridarbete

Job summary

Karolinska Universitetssjukhuset söker en bioinformatiker i rollen att tolka analysresultat från storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS) i solida tumörer. Du kommer att sammanställa och kvalitetssäkra underlag för patologer för slutlig medicinsk bedömning.

Placering vid GMCK med möjlighet till ökat ansvar över tid, samt bidrag till utvecklingen av tolkningsrutiner och samarbeten inom Genomic Medicine Sweden.

Qualifications

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område.
• Dokumenterad erfarenhet av bioinformisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
• Erfarenhet av cancer-genomik och/eller cancerbiologi.
• Mycket goda kunskaper i svenska och engelska i tal och skrift.

Responsibilities

• Tolka genetiska varianter (SNV, CNV, fusioner m.fl.) i storskalig sekvensering.
• Samarbeta nära och diskutera resultat med patologer, molekylärbiologer och kliniker.
• Bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av tolkningsflödena.
• Delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.

Skills

Noggrannhet

Strukturerad

Samarbete

Education

Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik

Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys

Tools

Linux/HPC

Python

Job description

Du erbjuds

• Ett meningsfullt arbete där din insats gör direkt nytta i patientdiagnostiken.
• En roll med goda utvecklingsmöjligheter och att över tid ta ett större ansvar.
• Möjlighet att arbeta i ett tvärvetenskapligt team med flexibla arbetstider och hybridarbete.
• Stöd för fortbildning och professionell utveckling i en inkluderande miljö på ett av världens främsta universitetssjukhus.

Självklart får du också ta del av våra generella förmånen som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder dig.

Om tjänsten

Tjänsten är placerad vid Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK), som är en del av Medicinsk diagnostik Karolinska (MDK). GMCK ansvarar för att tillhandahålla storskaliga och avancerade genomikanalyser till samtliga laboratoriemedicinska specialiteter inom MDK. Vårt uppdrag är att möjliggöra precisionsdiagnostik genom högkvalitativa genetiska analyser med fokus på klinisk relevans och teknisk spetskompetens.

I den här rollen blir du en del av vårt tolkningsteam inom solida tumörer. Huvudfokus ligger på att tolka bioinformatiska resultat från storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS) utifrån etablerade standardrutiner (SOP:er). Du sammanställer och kvalitetssäkrar underlagen som sedan lämnas över till patolog för slutgiltig medicinsk bedömning.

För rätt person finns det goda möjligheter att på sikt få ett utökat ansvar, samt bidra till vidareutvecklingen av våra tolkningsflöden och rutiner.

I Rollen Kommer Du Bland Annat Att

• tolka genetiska varianter (SNV, CNV, fusioner m.fl.).
• samarbeta nära och diskutera resultat med patologer, molekylärbiologer och kliniker.
• bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av tolkningsflödena.
• delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.
• delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS).

Vi söker dig som

• är noggrann, strukturerad och har hög ansvarskänsla för kliniska leveranser.
• har en god kommunikativ förmåga och trivs i gränssnittet mellan bioinformatik och medicinsk diagnostik.
• har ett engagemang för kvalitet och trivs med att samverka i grupp.

Krav

• Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område.
• Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
• Erfarenhet av arbete eller forskning inom cancergenomik och/eller cancerbiologi.
• Mycket goda kunskaper i svenska och engelska, i både tal och skrift (svenska krävs för den dagliga kommunikationen med övrig vårdpersonal).

Meriterande

• Doktorsexamen (PhD) inom relevant område.
• Praktisk erfarenhet av varianttolkning och/eller annotering av somatiska varianter inom cancergenomik.
• Erfarenhet av arbete som sjukhusgenetiker eller biträdande sjukhusgenetiker (eller motsvarande klinisk roll).
• Erfarenhet av arbete i klinisk sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189).
• Erfarenhet av, eller intresse för operativ samordning eller projektledning.
• Kunskap om klassificeringssystem för somatiska varianter (t.ex. AMP-riktlinjer).
• God programmeringsförmåga (t.ex. Python) och vana av Linux-miljöer/HPC.

Om rekryteringsprocessen

Urval och intervjuer kan komma att ske löpande under ansökningstiden.

I samband med din ansökan behöver du bifoga CV. Istället för ett personligt brev ber vi dig besvara urvalsfrågor samt kort motivera varför du passar för rollen. Att besvara frågorna är en förutsättning för att din ansökan ska anses komplett.

Varmt välkommen med din ansökan - Tillsammans är vi Karolinska!

Inför tillsättning av befattning som innefattar vård av barn och ungdom, kontrolleras den som erbjuds tjänsten mot misstanke- och belastningsregistret. Här kan du läsa mer om rekryteringsprocessen och om vilka kontroller som utförs på Karolinska.

Som anställd på Karolinska Universitetssjukhuset kan du komma att krigsplaceras. Läs mer om vad det innebär här.

Om du är eller tidigare har varit anställd i Region Stockholm kommer vi att ta interna referenser från din nuvarande eller tidigare chef om du blir aktuell för anställning.

För tillsvidaretjänster kan provanställning komma att tillämpas.

Om Karolinska Universitetssjukhuset

Vi på Karolinska Universitetssjukhuset är stolta över att vi är ett av världens främsta universitetssjukhus. Förutom vårt särskilda ansvar för den högspecialiserade vården i Stockholmsregionen är huvuduppdraget att tillsammans med Karolinska Institutet utbilda framtidens vårdanställda och bedriva världsledande forskning samtidigt som vi fortsätter vårt arbete med att utveckla vården för patientens bästa. Vi arbetar inom en rad olika områden och professioner.

Du kan läsa mer om vårt uppdrag inom vård, forskning och utbildning här.

Vår vision - Vi ska bota och lindra imorgon det ingen kan bota och lindra idag.

Läs gärna mer om oss på karolinska.se och följ oss på sociala medier!

Funktion Medicinsk Diagnostik Karolinska

Funktion Medicinsk Diagnostik Karolinska är en sammanslagning av Karolinska Universitetslaboratoriet och Bild och Funktion med laboratorieverksamhet, radiologi, nuklearmedicin, medicinsk strålningsfysik, radiofarmaci och strålsäkerhet inom Karolinska Universitetssjukhuset.

Här kan du läsa mer om Medicinsk Diagnostik Karolinska.

Här kan du läsa mer om Karolinska Universitetslaboratoriet.

Att söka jobb i Region Stockholm

Vi eftersträvar jämställdhet och jämlikhet på vår arbetsplats och ser gärna sökande med olika bakgrund och förutsättningar.

Vi tar endast emot ansökningar via detta system. Ansök genom att klicka på knappen ”Ansök”. Ansökningar per brev eller e-post beaktas inte. Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt säljare av ytterligare jobbannonser.

Vårt rekryteringssystem kan inte hantera anonyma ansökningar eller sökande med skyddade personuppgifter. Om du har skyddade personuppgifter ber vi dig att kontakta den kontaktpersonen som finns angiven i annonsen. Din ansökan kommer då att hanteras utanför rekryteringssystemet. Du bör även vara försiktig med vilken information du lämnar i din ansökan och endast ta med information som är relevant för den aktuella befattningen.

Region Stockholm ansvarar för hälso- och sjukvård, kollektivtrafik, regional utveckling och bidrar till kulturlivet. Varje dag, dygnet runt. I landets snabbaste växande region. Tillsammans skapar vi Europas attraktivaste storstadsregion.

Läs mer om hur det är att jobba hos oss i Region Stockholm (öppnas i nytt fönster)