Bioinformatician: Human Fat Tissue & scRNA-seq (Remote)

Karolinska Institutet; Solna kommun; Hybrid; SEK 781,000 - 1,060,000; Full time

Job summary

Karolinska Institutet söker bioinformatiker för ledande beräkningsarbete inom adipocytbiologi och fettvävnadsforskning. Du analyserar högdimensionella RNA-data och integrerar multi-omics under ett translationellt forskningsprogram.

Anställningen fokuserar på utveckling av robusta analyspipelines, samarbeten med experimentella forskare och publiceringsarbete. KI erbjuder flexibla arbetsarrangemang och internationell miljö.

Qualifications

• Doktorsexamen i beräkningsbiologi eller motsvarande.
• Expertis inom analys av encells-RNA-transkriptomikdata.
• Mycket god engelska i tal och skrift; samarbetsförmåga.
• Dokumenterad erfarenhet av att bygga reproducerbara pipelines.

Responsibilities

• Utveckla och underhålla arbetsflöden för bulk-, encell- och små-RNA-sekvenseringsdata.
• Analysera dataset för transkriptionsprogram och cellulära tillstånd.
• Samarbeta nära med laboratorieforskare för anpassade analyser.
• Bidra till projektstrategi, datatolkning och nya forskningsfrågor.
• Skriva manuskript, översiktsartiklar och forskningsansökningar.
• Handleda studenter och postdoktorer i beräkningsmetoder.
• Stödja bästa praxis för versionshantering och reproducibilitet.

Skills

Single-cell RNA-seq analysis

RNA-seq data analysis

Statistics & computational analysis

Reproducible pipelines

R/Python

Workflow tools (Snakemake)

Workflow tools (Nextflow)

Git

Multi-omics integration

English communication

Education

Doktorsexamen i beräkningsbiologi

Tools

Snakemake

Nextflow

Git

Job description

Karolinska Institutet söker bioinformatiker för ledande beräkningsarbete inom adipocytbiologi och fettvävnadsforskning. Du analyserar högdimensionella RNA-data och integrerar multi-omics under ett translationellt forskningsprogram.

Anställningen fokuserar på utveckling av robusta analyspipelines, samarbeten med experimentella forskare och publiceringsarbete. KI erbjuder flexibla arbetsarrangemang och internationell miljö.