Forsker

Oslo universitetssykehus HF; Norway; On-site; NOK 650,000 - 900,000; Full time

Benefits offered by this job

Velferdstilbud som teaterbilletter

Bedriftskor

Bedriftsidrettslag

Job summary

Oslo universitetssykehus HF søker en forsker til et engasjement på ett år med mulighet for forlengelse. Rollen fokuserer på automatisk analyse av FPM-bilder ved bruk av dyp læring og utvikling av metoder i biomedisinsk bildeanalyse.

Instituttet driver avansert forskning i kreftgenetikk og informatikk og bruker KI som verktøy i patologi og diagnostikk. Enheten tilbyr et forskningslaboratorium, robotisert bildedannelse og moderne programvareutvikling i et internasjonalt miljø.

Qualifications

• Vitenskapelig arbeid i team.
• Relevant dokumentasjon legges ved søknaden.
• Du er en lagspiller og har evnen til å samarbeide på tvers av ulike fagmiljøer.

Responsibilities

• Trening og testing av dyplæringsmodeller.
• Utvikle og evaluere nye metoder i biomedisinsk bildeanalyse.
• Utforske muligheter med FPM-avbildning og -bilder.
• Arbeide både selvstendig og i team med andre utviklere og forskere i et akademisk miljø.
• Analyse av medisinske forskningsdata.

Skills

Teamarbeid

Kreativitet

Samarbeid på tvers av fagmiljøer

Tools

TensorFlow

PyTorch

Windows

Linux

Job description

Forskerstilling knyttet til automatisk analyse av FPM-bilder ved bruk av dyp læring og utvikling av metoder i biomedisinsk bildeanalyse.

• Velferdstilbud som teaterbilletter, bedriftskor og bedriftsidrettslag

Institutt for kreftgenetikk og informatikk forsker innen biomedisin og informatikk og bruker informatikk og spesielt kunstig intelligens som verktøy for å studere genetiske og epigenetiske forandringer i kreft. Vi er verdensledende i bruk av kunstig intelligens i patologi og arbeider med å utvikle nye metoder for bedre kreftdiagnose, -prognose og tilpasning av behandling til den enkelte pasient. Instituttet benytter seg av moderne digital mikroskopi med flere patologiskannere og lysmikroskop som vi har robotisert for automatisk avbildning, og vi utvikler også egne skannere.

I prosjektet ENDPATH, et FRIPRO-prosjekt finansiert av Forskningsrådet, jobber vi med Fourier-ptychografisk mikroskopi (FPM) som avbilder patologiprøver fra ulike vinkler med ulike bølgelengder. Vi har utviklet et høyhastighets FPM-system som vi nå skal bruke til å avbilde mange patologiprøver og analysere disse med dyp læring for å gjøre mer presiser vurderinger av patologiprøver enn det man kan med vanlige mikroskoper. Vi har et eget forskningslaboratorium og en høyspesialisert programvareutviklergruppe.
Seksjon for anvendt informatikk ved Institutt for kreftgenetikk og informatikk søker etter 1 dyktig forsker til et engasjement på 1 år med mulighet for forlengelse til å jobbe med automatisk analyse av FPM-bildene, spesielt ved bruk av dyp læring.
Seksjonen har en egen enhet for applikasjonsutvikling som i dag består av 20 medarbeidere innen forskning og utvikling. Vi utvikler applikasjoner og algoritmer for forskningsprosjekter ved instituttet der et hovedmål er å utvikle prognostiske markører for kreftpasienter basert på ulike bildemodaliteter. Vi bruker kunstig intelligens (KI) og dyp læring med nevrale nett for oppgaver som segmentering og klassifikasjon, med rammeverk som TensorFlow og PyTorch. Vi utvikler applikasjoner på plattformene Windows, Linux, samt at vi har noe web-utvikling i enkelte prosjekter. Utviklerne våre jobber ofte tett sammen med brukere og forskere, og en viktig del av jobben er å sette seg inn i og forstå deres behov.

Oslo universitetssykehus er en arbeidsplass med stort mangfold. Vi mener dette er avgjørende for å løse våre oppgaver på best mulig måte. Vi ønsker at dette mangfoldet skal gjenspeiles blant søkerne til våre stillinger, og oppfordrer alle kvalifiserte kandidater, uavhengig bakgrunn, til å søke!

• Trening og testing av dyplæringsmodeller
• Utvikle og evaluere nye metoder i biomedisinsk bildeanalyse
• Utforske muligheter med FPM- avbildning og -bilder
• Arbeide både selvstendig og i team med andre utviklere og forskere i et akademisk miljø
• Analyse av medisinske forskningsdata

For å trives med arbeidsoppgaver hos oss, ser vi etter deg som har følgende kvalifikasjoner:

• Vitenskapelig arbeid i team

Vi ber om at relevant dokumentasjon legges ved søknaden.

• Du er en lagspiller og har evnen til å samarbeide på tvers av ulike fagmiljøer
• Du ønske om å arbeide og bidra i forskningsprosjekter som en del av et team
• Du er motivert, nysgjerrig og kreativ, ryddig og løsningsorientert
• Du blir en del av et spennende og innovativt forskningsmiljø på høyt nivå
• Du blir en del av et viktig samfunnsoppdrag,
• Vi tar vare på våre nye medarbeidere og støtter deg gjennom oppstartsfasen med vårt sentrale nyansattprogram, les mer: https://www.oslo-universitetssykehus.no/om-oss/jobb-og-utdanning/arbeidsplassen-var/velkommen-med-pa-laget/
  
• Vi har velferdstilbud for våre medarbeidere, f. eks. teaterbilletter, bedriftskor, bedriftsidrettslag m.m.

I Oslo universitetssykehus driver vi med avansert pasientbehandling, forskning, utprøvende behandling, undervisning og innovasjon på et høyt internasjonalt nivå. Vi er derfor hele Norges bakvakt! Vi trenger deg med på laget.
Høres dette ut som en stilling for deg? Vi gleder oss til å lese din søknad.

• Kunstig nevralt nettverk

Sammen med pasienten utvikler vi morgendagens behandling
Oslo universitetssykehus med våre 25 000 medarbeidere skal være en lærende og skapende organisasjon med evne til å tenke nytt. Vi skal ha en ledende rolle i utvikling av forskning og innovasjon, samt utvikling av morgendagens helsetjeneste, medisinsk behandling og presisjonsmedisin. Hos oss finner du noen av landets ledende eksperter innen sine fagfelt, og her blir du en del av Norges største helsefaglige arbeidsplass. Et inkluderende arbeidsmiljø preget av åpenhet og respekt er svært viktig for oss. Uansett hva du jobber med vil du få muligheten til å utvikle deg og benytte kompetanse på et sted hvor det virkelig teller.

Seksjonsleder