Postdoctoraal Onderzoeker Computationele Immunologie

LUMC; Netherlands; A distancia; EUR 42.000 - 65.000; Jornada completa

Ventajas ofrecidas por este puesto de trabajo

Eindejaarsuitkering 8,3%

Vakantiegeld

Fietsregeling

Sportbudget

Thuiswerkvergoeding

Uitstekende reiskostenregeling

Descripción de la vacante

Het LUMC zoekt een Postdoctoraal Onderzoeker Computationele Immunologie die complex data-analyse en computationele strategieën ontwikkelt voor multi-omics datasets. U werkt samen met humane en moleculaire immunologen aan analyses die mechanistische verklaringen voor immuunvariatie en vaccinreacties proberen te ontrafelen.

De functie combineert computationeel en experimenteel onderzoek en vereist een promovenda met ervaring in high-dimensional data en ML.

Formación

• PhD in systeembiologie van het immuunsysteem of bio-informatica.
• Ervaring met analyse van hoog-dimensionale biologische datasets.
• Sterke programmeervaardigheden en ervaring met HPC.

Responsabilidades

• Ontwikkelen en toepassen computationele strategieën voor integratie en analyse van complexe datasets.
• Vertalen van analytische bevindingen naar biologisch hypotheses en vervolgonderzoek.
• Communiceren van onderzoeksresultaten met immunologen en clinici.
• Samenwerken met teamleden om hypotheses experimenteel te valideren.

Conocimientos

Biomedische data-analyse

Machine learning

HPC/High-performance computing

Engelssprekende communicatie

Educación

PhD in systeembiologie van het immuunsysteem of bio-informatica

Herramientas

Python

R

HPC

Descripción del empleo

Postdoctoraal Onderzoeker Computationele Immunologie

Je hebt nog 13 dag(en) om te solliciteren

Wij hebben een vacature voor een Postdoctoraal Onderzoeker Computationele Immunologie en zijn op zoek naar een zeer gemotiveerde onderzoeker met expertise in bio-informatica en/of systeembiologie van het immuunsysteem. Je werkt nauw samen met humane en moleculaire immunologen aan grootschalige datasets afkomstig van menselijke studies. Het overkoepelende doel is het identificeren van mechanismen die ten grondslag liggen aan variatie in immuunresponsen op infecties en vaccinaties.

Deel deze pagina

Het onderzoek richt zich op het ontwikkelen en toepassen van computationele strategieën voor de integratie en analyse van complexe immunologische datasets. Samen met de betrokken onderzoeksteams interpreteer je onderzoeksresultaten binnen biologische en immunologische kaders. De focus ligt niet alleen op het beschrijven van variatie binnen het immuunsysteem en de respons op vaccinatie, maar ook op het identificeren van onderliggende mechanismen en het richting geven aan vervolgonderzoek met een experimenteel en translationeel karakter.

Je belangrijkste werkzaamheden zijn:

• Ontwikkelen en toepassen van computationele strategieën voor de integratie en analyse van complexe, hoog-dimensionale datasets.
• Vertalen van analytische bevindingen naar biologische hypothesen en het identificeren van mechanismen die richting geven aan vervolgonderzoek.
• Communiceren van onderzoeksresultaten met immunologen, clinici en andere samenwerkingspartners.
• Samenwerken met onderzoekers binnen het team om de gegenereerde hypothesen experimenteel te valideren.

Deze functie combineert computationeel en experimenteel onderzoek. Met jouw werk draag je bij aan een beter begrip van immuunvariatie en de mechanismen die hieraan ten grondslag liggen.

Waar ga je werken?

Ons onderzoek richt zich op het begrijpen van het immuunsysteem tijdens infectieziekten en na vaccinatie. Hierbij combineren wij hoog-dimensionale multi-omicsbenaderingen met experimentele humane studies die worden uitgevoerd in verschillende geografische regio's. De blootstelling aan micro-organismen en parasieten verschilt aanzienlijk tussen deze gebieden. Ons doel is om zowel mondiale als regionaal specifieke immuunkenmerken te identificeren die bijdragen aan beschermende immuniteit tegen infectieziekten. Deze inzichten ondersteunen de ontwikkeling van effectieve vaccins.

Ons laboratorium genereert en analyseert complexe datasets met behulp van technieken zoals massa- en flowcytometrie, single-cell RNA-sequencing (single-cell RNA-seq), BCR/TCR-sequencing, single-cell ATAC-seq en ruimtelijke transcriptomics. Daarnaast worden ook andere moleculaire en klinische metingen geïntegreerd. Deze datasets worden aangevuld met gegevens afkomstig uit internationale samenwerkingsverbanden.

De resultaten van onze multi-omicsanalyses worden gebruikt om de functionele consequenties van immuunvariatie te onderzoeken. Zo worden antigeenspecifieke B-celprojecten aangevuld met functionele testen met monoklonale antilichamen, waaronder analyses van antigeenbinding en de capaciteit om pathogenen te neutraliseren. De responsiviteit van T-cellen wordt onderzocht met behulp van specifieke adjuvantia, immuunmodulatoren en metabole interventies.

Wat neem je mee?

Complexe immunologische vraagstukken prikkelen jouw nieuwsgierigheid en motiveren je om nieuwe oplossingen te verkennen. Met een originele benadering van wetenschappelijke uitdagingen weet je nieuwe ideeën te ontwikkelen en effectief samen te werken met andere onderzoekers. Je bent gedreven om de wetenschappelijke kennis verder te vergroten en kunt complexe onderzoeksbevindingen helder communiceren naar verschillende samenwerkingspartners.

Daarnaast beschik je over:

• Een afgeronde promotie (PhD) in systeembiologie van het immuunsysteem (systems immunology) of bio-informatica, met ervaring in de analyse van hoog-dimensionale biologische datasets.
• Aantoonbare ervaring met de analyse van grootschalige, multimodale single-cell datasets met behulp van statistische methoden en machine-learningtechnieken.
• Sterke programmeervaardigheden en ervaring met high-performance computing.
• Uitstekende mondelinge en schriftelijke communicatieve vaardigheden in het Engels.

Ervaring met, of interesse in, het toepassen van opkomende kunstmatige-intelligentie(AI)-methoden op complexe immunologische datasets strekt tot aanbeveling

Wat bieden we jou?

Door gezondheid gedreven; dat is onze missie. Dit geldt uiteraard niet alleen voor onze patiënten maar ook voor onze medewerkers. We streven naar een veilige, inclusieve en gelijkwaardige werkomgeving waarin talentontwikkeling en verbindend leadership centraal staan. Om te kunnen blijven leren en ontwikkelen bieden wij interne opleidingen en bijscholing aan. Daarnaast heb je recht op een eindejaarsuitkering (8,3%), vakantiegeld, fietsregeling, sportbudget, thuiswerkvergoeding en een uitstekende reiskostenregeling voor woon-werkverkeer. Ook ben je als medewerker van het LUMC aangesloten bij het ABP pensioenfonds. Dit betekent dat maar liefst 70% van je pensioenpremie betaald wordt door het LUMC en je daardoor netto meer salaris over houdt. Wel zo fijn!

Als academisch medisch centrum streeft het LUMC naar een medewerkersbestand dat een goede afspiegeling is van de samenleving. Wij zetten ons in voor de hoogste kwaliteit op het gebied van gezondheidszorg, onderwijs en (internationaal) onderzoek, waarbij diverse perspectieven van cruciaal belang zijn. Duurzaamheid staat bij ons ook hoog in het vaandel: we zetten ons in voor een gezonde toekomst, niet alleen voor mensen, maar ook voor de planeet. In lijn met deze waarden willen we een creatieve en inspirerende werkplek zijn, waar het voor ons van essentieel belang is dat iedereen zich thuis, veilig en erkend voelt. Bij ons draait het om wie je bent en wat je bijdraagt, ongeacht je achtergrond. Samen werken wij aan een duurzame en inclusieve toekomst, zowel voor de mensen om ons heen als voor de wereld waarin we leven. Samen zijn wij LUMC.

• interne opleidingen en bijscholing aan
• eindejaarsuitkering (8,3%)
• vakantiegeld
• fietsregeling
• sportbudget
• thuiswerkvergoeding
• uitstekende reiskostenregeling voor woon-werkverkeer
• ABP pensioenfonds

Meer informatie

• Als Postdoctoraal Onderzoeker Computationele Immunologie bedraagt je salaris tussen € 3.724 en € 5.867 bruto per maand (schaal 10 van de Cao Universitair Medische Centra), op basis van een fulltime dienstverband.
• Het betreft een tijdelijke aanstelling gekoppeld aan de looptijd van het onderzoeksproject.
• De duur van het dienstverband bedraagt drie jaar.
• Per 1 mei 2027 wordt een salarisverhoging van 3,5% doorgevoerd.
• Deze vacature staat open voor zowel interne als externe kandidaten. Conform het LUMC-beleid krijgen interne kandidaten bij gelijke geschiktheid voorrang in de selectieprocedure.
• Werving- en selectiebureaus wordt vriendelijk verzocht niet op deze vacature te reageren.