Synthèse bio-inspirée de C-Galactofuranosides par ingénierie de la poche catalytique de glycosidases

Nantes Université; France; Sur place; EUR 25 000 - 30 000; Plein temps

Résumé du poste

Une université française recherche un doctorant pour un projet de thèse en biologie, axé sur le développement d'une méthode écologique pour la synthèse de C-hexofuranosides d'alkyle. Le candidat idéal possède un master en biotechnologie ou disciplines liées, avec un intérêt pour la chimie organique et la bio-informatique. Une bonne maîtrise de l'anglais est appréciée.

Qualifications

• Un master ou diplôme d'ingénieur en biotechnologie, biochimie, biologie moléculaire ou chimie-biologie.
• Intérêt pour la recherche interdisciplinaire.
• Capacité à travailler en équipe.

Responsabilités

• Développement d'une alternative écologique pour la synthèse de C-hexofuranosides d’alkyle.
• Production et purification d’enzymes mutées.
• Tests des enzymes pour leur capacité à former des C-hexofuranosides.

Connaissances

Chimie organique

Bio-informatique

Travail en équipe

Anglais (parlé et écrit)

Formation

Master en biotechnologie

Diplôme d'ingénieur

Description du poste

Contexte et objectif

Le galactofuranose (Galf) est l'un des hexofuranoses les plus abondants identifiés à ce jour et a été trouvé dans le glycocalyx de certains micro-organismes, souvent pathogènes comme Leishmania, Trypanosoma ou Mycobactéria, ainsi que dans certains champignons, algues ou organismes symbiotiques comme les lichens1,2. Comme le squelette du Galf est complètement xénobiotique chez les mammifères, il constitue une cible intéressante en tant que nouveau pharmacophore. Ainsi, différentes familles de dérivés O- et S-galactofuranosides d’alkyle ont montré de bonne inhibition de la croissance de souche de mycobacterie ou de leishmanie avec une concentration minimale inhibitrice de l’ordre du micromolaire3,4. Cependant, l’utilisation de tels glycosides est limitée de par leur forte sensibilité à l’hydrolyse. Le passage d’une liaison O-glycosidique à une liaison C-glycosidique permet de limiter cette hydrolyse et les C-galactofuranoses présentent ainsi un potentiel thérapeutique indéniable. La synthèse organique de ces molécules nécessite néanmoins l’utilisation de métaux de transition souvent toxiques, coûteux, difficiles à éliminer et qui ont un impact environnemental négatif.

Dance ce contexte, le projet de thèse proposé consistera au développement d’une alternative plus respectueuse de l’environnement basée sur des réactions se déroulant dans des conditions douces en milieu aqueux. Le principe du projet repose en particulier sur la création de novo d'une nouvelle activité enzymatique, à savoir la C-glycoligation, grâce au remodelage du sous-site +1 d'une glycosidase. Plus précisément, nous allons adapter la poche catalytique d'une arabinofuranosidase en y incorporant un acide aminé non canonique apportant une nouvelle réactivité afin d'obtenir des C‑hexofuranosides d’alkyle d’intérêt. Durant la thèse, le.la doctorant.e produira et purifiera les enzymes mutées contenant différents acides aminés non canoniques à des positions déterminées préalablement par bioinformatique. Il. Elle testera ensuite les enzymes pour leur capacité à former des C-hexofuranosides d’alkyle.

Funding category: Autre financement public

ANR PRC

PHD title: Doctorat de Biologie

PHD Country: France

Qualifications et profil recherché

Un master ou un diplôme d\'ingénieur en biotechnologie, biochimie, biologie moléculaire ou chimie-biologie, et un intérêt pour la chimie organique et la bio-informatique. Intérêt pour la recherche interdisciplinaire. Capacité à travailler en équipe. La maîtrise de l\'anglais parlé et écrit serait très appréciée.