Stagiaire M2 en Epilepsie MTLE — Neuroscience & Omics

Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière; Paris; Hybride; EUR 10 000 - 15 000; Plein temps

Résumé du poste

L’Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière à Paris propose un stage Master 1 dans une équipe pluridisciplinaire travaillant sur l’épilepsie MTLE, avec un accès direct à des données humaines et à des plateformes technologiques.

Le stagiaire participera à la collecte des tissus, à l’analyse de transcriptomique spatiale et de snRNA-seq via des pipelines Python (Scanpy, Squidpy, cell2location, Tangram) et à l’intégration des données épileptologiques avec les données omiques.

Qualifications

• Master 1 (ou équivalent) en neurosciences, bioinformatique, biologie computationnelle ou discipline quantitative.
• Maîtrise de Python et/ou Matlab.
• Connaissances de base en neurobiologie et en analyses omiques souhaitées.

Responsabilités

• Collecte et préparation des tissus cérébraux et réalisations des enregistrements in vitro.
• Analyse et traitement de données de transcriptomique spatiale et de snRNA-seq avec les pipelines Python (Scanpy, Squidpy, cell2location, Tangram).
• Enregistrement et intégration de données electrophysiologiques avec les données omiques spatiales.
• Développement de scripts d’analyse en Python pour l’expression différentielle spatiale et la déconvolution cellulaire.
• Travail en laboratoire L2 et collaboration avec l’équipe pluridisciplinaire.

Connaissances

Python

Matlab

Neuroscience basics

Formation

Master 1 en neurosciences / bioinformatique / biologie computationnelle

Outils

Scanpy

Squidpy

cell2location

Tangram

HD-MEA

Description du poste

L’Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière à Paris propose un stage Master 1 dans une équipe pluridisciplinaire travaillant sur l’épilepsie MTLE, avec un accès direct à des données humaines et à des plateformes technologiques.

Le stagiaire participera à la collecte des tissus, à l’analyse de transcriptomique spatiale et de snRNA-seq via des pipelines Python (Scanpy, Squidpy, cell2location, Tangram) et à l’intégration des données épileptologiques avec les données omiques.